RNA–Protein interactions for RNA: YHR153C

SPO16, Transcript of Meiosis-specific protein involved in synaptonemal complex assembly, yeast

Gene SPO16, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO16	YHR153C	UFD4	P33202	1483 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	SUC2	P00724	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	APE1	P14904	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	CDC23	P16522	626 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	EXO70	P19658	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	UTR4	P32626	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	PMT1	P33775	817 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	RIM2	P38127	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	DUG2	P38149	878 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	RTT107	P38850	1070 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	YJL070C	P40361	888 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	YJL068C	P40363	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	VTC2	P43585	828 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	IVY1	Q04934	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	DRS2	P39524	1355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	GPI1	P53306	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	SLG1	P54867	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	RHO2	P06781	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	REC107	P21651	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	GYP6	P32806	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	MSN2	P33748	704 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	CBP4	P37267	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	YGL108C	P53139	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	BNA5	Q05979	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	CHD1	P32657	1468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	SPS4	P09937	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	PPZ1	P26570	692 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	RAD14	P28519	371 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
SPO16	YHR153C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	SLD5	Q03406	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	TAP42	Q04372	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	RBA50	Q04418	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	VPS74	Q06385	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO16	YHR153C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	BUD14	P27637	709 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	REC114	P32841	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	BYE1	P36106	594 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	PHO92	Q06390	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	AFG1	P32317	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	HCS1	P34243	683 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	IKS1	P47042	667 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	CRZ1	P53968	678 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	SOV1	Q04748	898 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	SYO1	Q07395	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	YUR1	P26725	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	YAT2	P40017	923 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	POP1	P41812	875 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	ELP2	P42935	788 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	YGR149W	P48236	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	IRC15	Q02733	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	FRE1	P32791	686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	PTR2	P32901	601 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	SAS3	P34218	831 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	FAU1	P40099	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	FMS1	P50264	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	NRT1	Q08485	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	DAP1	Q12091	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	CYB2	P00175	591 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	PDX1	P16451	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	ATP11	P32453	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	NDC1	P32500	655 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO16	YHR153C	VPS52	P39904	641 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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