RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	YCR043C	P25361	127 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	AFG1	P32317	509 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	PHD1	P36093	366 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	THI2	P38141	450 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RCF1	Q03713	159 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	NUP53	Q03790	475 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	BSC1	Q12140	328 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ARP6	Q12509	438 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	BAR1	P12630	587 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.07	□□□□□ -1.92	not detected
VMA10	YHR039C-A	TYR1	P20049	452 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ATP11	P32453	318 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	TFB1	P32776	642 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RRT2	P38332	387 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ERG7	P38604	731 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YER130C	P39959	443 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SYG1	P40528	902 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.07	□□□□□ -1.92	not detected
VMA10	YHR039C-A	URB2	P47108	1174 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	COS5	P47187	383 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	FMS1	P50264	508 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SKO1	Q02100	647 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RSF1	Q05043	376 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	COS7	Q07788	383 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	THI20	Q08224	551 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RIP1	P08067	215 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ATP10	P18496	279 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MGR1	P25573	417 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GEX1	P25596	615 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SWI3	P32591	825 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	UTR4	P32626	227 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MET30	P39014	640 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	JEM1	P40358	645 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GUF1	P46943	645 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SCS3	P53012	380 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YGL138C	P53122	345 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SAM50	P53969	484 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	BET4	Q00618	327 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SMA1	Q02651	245 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	OAZ1	Q02803	292 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ERO1	Q03103	563 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MSS11	Q03825	758 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YMR254C	Q04838	102 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SEC63	P14906	663 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MNE1	P24720	663 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YCR007C	P25354	239 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	PPZ1	P26570	692 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ACH1	P32316	526 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	NIP100	P33420	868 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ARA1	P38115	344 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SLM4	P38247	162 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	EFM2	P38347	419 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	APE4	P38821	490 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	LCB2	P40970	561 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MEP2	P41948	499 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	HOT1	Q03213	719 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SLD5	Q03406	294 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ACL4	Q03771	387 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GLO2	Q05584	274 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	BNA5	Q05979	453 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MMR1	Q06324	491 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	PHO92	Q06390	306 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.05	□□□□□ -1.92	not detected
VMA10	YHR039C-A	VAM3	Q12241	283 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GPM3	Q12326	303 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	HIP1	P06775	603 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YUR1	P26725	428 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	KRE2	P27809	442 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	HIR2	P32480	875 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GYP6	P32806	458 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MDL1	P33310	695 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ECM15	P35195	104 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RFC3	P38629	340 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YIL169C	P40442	995 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	CSM2	P40465	213 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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