RNA–Protein interactions for RNA: YGL067W

NPY1, Transcript of NADH diphosphatase (pyrophosphatase), yeast

Gene NPY1, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NPY1	YGL067W	BCP1	Q06338	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	ARV1	Q06541	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	STP4	Q07351	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	RTR2	Q12378	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	FMP16	Q12497	93 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	URA3	P03962	267 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	COR1	P07256	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	PCK1	P10963	549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	PMA2	P19657	947 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YCL049C	P25577	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	PEX3	P28795	441 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	TFC1	P32367	649 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YBR139W	P38109	508 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YHI9	P38765	294 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	APE4	P38821	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	SEO1	P39709	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	IRC6	P43615	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	RAD17	P48581	401 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	NAS6	P50086	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	MUP1	P50276	574 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	MNT2	P53059	558 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	CGR1	P53188	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	TIM44	Q01852	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	NRG1	Q03125	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	GAD1	Q04792	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	CIA1	Q05583	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	CRD1	Q07560	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	FRE5	Q08908	694 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	MED2	Q12124	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	ATG31	Q12421	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	RPN13	O13563	156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	STE12	P13574	688 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	APN1	P22936	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	RRT12	P25381	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	TFB1	P32776	642 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	OAR1	P35731	278 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	NUP133	P36161	1157 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
NPY1	YGL067W	MEP1	P40260	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YGR210C	P42942	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	MEP3	P53390	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	SNF12	P53628	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	GAL83	Q04739	417 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	RNH1	Q04740	348 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	KSS1	P14681	368 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	HEM15	P16622	393 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	SPO16	P17122	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	SIR1	P21691	654 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	ITR1	P30605	584 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	MOH1	P38191	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	YBR285W	P38354	144 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	SPC97	P38863	823 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	PUG1	P40100	303 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	NDE1	P40215	560 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	UBP7	P40453	1071 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	MAD2	P40958	196 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	SAD1	P43589	448 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	DID2	P69771	204 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	MAK10	Q02197	733 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NPY1	YGL067W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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