RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	RRI2	Q12348	645 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YOS9	Q99220	542 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NUP192	P47054	1683 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-H	O13535	1793 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PHO5	P00635	467 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SPO12	P17123	173 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	AEP2	P22136	580 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CMK2	P22517	447 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NTG1	P31378	399 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PMT2	P31382	759 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YET1	P35723	206 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ELF1	P36053	145 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CAF4	P36130	643 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	FLO10	P36170	1169 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SWC5	P38326	303 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ATG7	P38862	630 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	AIM2	P39721	246 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	VFA1	P40080	203 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YTA12	P40341	825 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DOT5	P40553	215 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CIN5	P40917	295 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YNL320W	P42840	284 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PMT6	P42934	759 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	EPL1	P43572	832 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RPC17	P47076	161 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	COX16	P47081	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	AIM24	P47127	394 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MNT2	P53059	558 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YGR016W	P53209	190 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ZDS2	P54786	942 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ACL4	Q03771	387 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TAF11	Q04226	346 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PEX10	Q05568	337 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PDR8	Q06149	701 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ALE1	Q08548	619 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	FEX1	Q08913	375 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HER1	Q12276	1246 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ATG31	Q12421	196 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	VCX1	Q99385	411 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	POL3	P15436	1097 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	STE4	P18851	423 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	EXO70	P19658	623 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PGS1	P25578	521 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CWH43	P25618	953 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DAL3	P32459	195 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HXT4	P32467	576 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	KRE6	P32486	720 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MRPL7	P36519	292 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YBR032W	P38223	100 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YBR071W	P38243	211 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SLM4	P38247	162 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RXT2	P38255	430 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YMR262W	P38430	313 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YHR033W	P38690	423 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SSO2	P39926	295 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HPM1	P40481	377 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GTT1	P40582	234 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RTS2	P40962	232 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MAD3	P47074	515 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YDL183C	P48569	320 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SAP4	P53036	818 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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