RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C THI3Q07471 609 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C XYL2Q07993 356 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PPM2Q08282 695 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C FEX2Q08991 375 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C HAL9Q12180 1030 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C HOS1Q12214 470 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C GTT2Q12390 233 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RPL24AP04449 155 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
DOA4YDR069C KIN28P06242 306 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C HPR1P17629 752 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C APA2P22108 325 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C AMD2P22580 549 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C GRR1P24814 1151 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C DMC1P25453 334 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ATG22P25568 528 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C CDC50P25656 391 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PEX3P28795 441 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C CCR4P31384 837 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RPC25P35718 212 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C SCO2P38072 301 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C POA1P38218 177 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C CST26P38226 397 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ERV46P39727 415 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PIG2P40187 538 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C VHR1P40522 640 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C HXT9P40885 567 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C LOC1P43586 204 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C TAF4P50105 388 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RMR1P53060 241 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ART5P53244 586 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C MRPL22P53881 309 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ROT1Q03691 256 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C VHS1Q03785 461 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PEX10Q05568 337 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C CRR1Q05790 422 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C BOP2Q06150 570 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C SPH1Q06160 661 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ECM7Q06200 448 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PGC1Q08959 321 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C YPL272CQ08984 517 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C NYV1Q12255 253 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C DGK1Q12382 290 aa3.12□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ATP4P05626 244 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C HSF1P10961 833 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C UTR1P21373 530 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RRP43P25359 394 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RPD3P32561 433 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C MGM101P32787 269 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C CTF13P35203 478 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PEX32P38292 413 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PLB1P39105 664 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PRM9P39551 298 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C NPR2P39923 615 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RMD6P39975 231 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C DSE1P40077 573 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C UBC12P52491 188 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PRM1P53835 661 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C DID2P69771 204 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C YPL068CQ02749 293 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C MSC2Q03455 724 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C TRM82Q03774 444 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C SEG1Q04279 960 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C MLH3Q12083 715 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C APC9Q12107 265 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RAD61Q99359 647 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ADR1P07248 1323 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C SEM1O94742 89 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C UGA1P17649 471 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C MGR1P25573 417 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PHA2P32452 334 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C IMP3P32899 183 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C VPS17P32913 551 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C SEF1P34228 1148 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ELF1P36053 145 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C MRPL3P36516 390 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C SSH1P38353 490 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C SUL1P38359 859 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C AIM18P38884 321 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RGI2P40188 164 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C PSF2P40359 213 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C IRC6P43615 237 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C UPF3P48412 387 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C DOC1P53068 250 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C ALG12P53730 551 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C FOL1P53848 824 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C SIZ1Q04195 904 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RCO1Q04779 684 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C COS7Q07788 383 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C NTG2Q08214 380 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C GIS3Q12418 502 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C VCX1Q99385 411 aa3.11□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
DOA4YDR069C GCN4P03069 281 aa3.1□□□□□ -1.91
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