RNA–Protein interactions for RNA: YCL036W

GFD2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene GFD2, Length 1,701 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GFD2	YCL036W	UGO1	Q03327	502 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	RGT2	Q12300	763 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	AI3	P03877	415 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	BCK2	P33306	851 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YKL097C	P34245	136 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	EMC3	P36039	253 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	TAE1	P38340	232 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	AGP3	P43548	558 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YFR018C	P43599	363 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	ZRG17	P53735	605 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	IRC15	Q02733	499 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	GPI11	Q06636	219 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	ATG10	Q07879	167 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	PRI2	P20457	528 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	CMK2	P22517	447 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	HXT4	P32467	576 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	CDC5	P32562	705 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	ATG7	P38862	630 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	HXT7	P39004	570 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	ERV46	P39727	415 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	MPH1	P40562	993 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	AIM22	P47051	409 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	GCV1	P48015	400 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	GIP3	Q03016	1276 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	PEX12	Q04370	399 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	GRS2	Q06817	618 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	GET4	Q12125	312 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	PEX3	P28795	441 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	AQR1	P53943	586 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	REH1	Q06709	432 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	TRM8	Q12009	286 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	DAP2	P18962	818 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	BET2	P20133	325 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	DMC1	P25453	334 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	SEC17	P32602	292 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	SWD1	P39706	426 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YEL073C	P39974	107 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	ELP2	P42935	788 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	SPR6	Q01684	191 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YOL131W	Q08270	108 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	ATP4	P05626	244 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	RAD7	P06779	565 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YBR071W	P38243	211 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	COS111	P38308	924 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YNL140C	P53910	189 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YLL007C	Q07799	665 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	LOT6	Q07923	191 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	MPD2	Q99316	277 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	PTP2	P29461	750 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	GLG1	P36143	616 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	RBG1	P39729	369 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	CAB2	P40506	365 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	STT4	P37297	1900 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GFD2	YCL036W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	VPH2	P32341	215 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YHL012W	P38709	493 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	GIC1	P38785	314 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YHR078W	P38799	552 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YNR068C	P53754	272 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	TGL2	P54857	326 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ATG29	Q12092	213 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	FAB1	P34756	2278 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YKR104W	P0CE69	306 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	UNG1	P12887	359 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	POL4	P25615	582 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	GUT1	P32190	709 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	RIC1	P40395	1056 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	11.7	□□□□□ -0.54	not detected
GFD2	YCL036W	YFR020W	P43600	232 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	MET12	P46151	657 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YDR239C	Q03780	787 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ARG7	Q04728	441 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	NTO1	Q12311	748 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	HIS5	P07172	385 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	COR1	P07256	457 aa		11.69	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms