RNA–Protein interactions for RNA: YBR215W

HPC2, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HPC2, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPC2	YBR215W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	ENV7	Q12003	364 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	HMS1	Q12398	434 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SPE4	Q12455	300 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	CBS2	P14905	389 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	VAC17	P25591	423 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YPT7	P32939	208 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	DTR1	P38125	572 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	NEM1	P38757	446 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	FET3	P38993	636 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	END3	P39013	349 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YER186C	P40101	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SLM1	P40485	686 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	BRE2	P43132	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	APC4	Q04601	652 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SGO1	Q08490	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	RAX1	Q08760	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	BTS1	Q12051	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SNT2	P53127	1403 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SCEI	P03882	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	HIP1	P06775	603 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	PEP5	P12868	1029 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	CBF1	P17106	351 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	NTH1	P32356	751 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	ERG7	P38604	731 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	AIM46	P38885	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	BIT61	P47041	543 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	COG1	P53079	417 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YNR071C	P53757	342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	RIM13	Q03792	727 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	GIS1	Q03833	894 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	PLP1	Q04004	230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	QCR2	P07257	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	MGR1	P25573	417 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YCR101C	P25607	182 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	PRE4	P30657	266 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	TCA17	P32613	152 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	RIB1	P38066	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	DUG2	P38149	878 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	IML3	P38265	245 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YBR259W	P38338	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SEN34	P39707	275 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YJL118W	P47022	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	NPA3	P47122	385 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	AAD10	P47182	288 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	AMA1	P50082	593 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	MTQ1	P53944	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YAT1	P80235	687 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	ACS1	Q01574	713 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	SKO1	Q02100	647 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	DXO1	Q06349	442 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	CDA1	Q06702	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	CDA2	Q06703	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	AAD4	Q07747	329 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	ATG9	Q12142	997 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	RPN6	Q12377	434 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	YPT6	Q99260	215 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	FKH2	P41813	862 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	INN1	P53901	409 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	MSC2	Q03455	724 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	CAB5	Q03941	241 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	COX20	Q04935	205 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	FAR8	Q05040	523 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	RFU1	Q08003	200 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	RSB1	Q08417	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPC2	YBR215W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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