RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	NCOA1	Q15788	1441 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ADGRL2	O95490	1459 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	VSTM5	A8MXK1	200 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	DYRK3	O43781	588 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TCIRG1	Q13488	830 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	NKG7	Q16617	165 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TNKS	O95271	1327 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM6B	O15054	1643 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP69	A5D8W1	941 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	NPHP1	O15259	732 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ACR	P10323	421 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CAP2	P40123	477 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF43	Q68DV7	783 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC6A19	Q695T7	634 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM87B	Q96K49	555 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	LZTS1	Q9Y250	596 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRK	Q15262	1439 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	HTR3A	P46098	478 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK5R2	Q13319	367 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	DHCR24	Q15392	516 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CNTD1	Q8N815	330 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	COG1	Q8WTW3	980 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	SARG	Q9BW04	601 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXQ1	Q9C009	403 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	USP25	Q9UHP3	1055 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	PLXNC1	O60486	1568 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	RERE	Q9P2R6	1566 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP10A	O60312	1499 aa		6.19	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQU0	124 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	EXOC5	O00471	708 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJA2	O60884	412 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	LRIG2	O94898	1065 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	COL6A1	P12109	1028 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	FST	P19883	344 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ADM	P35318	185 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	NFIA	Q12857	509 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	MLEC	Q14165	292 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TPH2	Q8IWU9	490 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	PAF1	Q8N7H5	531 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	PJA1	Q8NG27	643 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	GATA6	Q92908	595 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC6	Q99741	560 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	MTFR1L	Q9H019	292 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP7A	Q04656	1500 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	HFM1	A2PYH4	1435 aa		6.18	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		6.17	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	GSC2	O15499	205 aa		6.17	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	BRINP1	O60477	761 aa		6.17	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TCEA3	O75764	348 aa		6.17	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV1-40	P01703	118 aa		6.17	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	SERPINB3	P29508	390 aa		6.17	□□□□□ -1.42
EFHC1-223	ENST00000636616	TMPRSS15	P98073	1019 aa		6.17	□□□□□ -1.42

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