RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 PIGSQ96S52 555 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SENP2Q9HC62 589 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 NEFLP07196 543 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 ITGB8P26012 769 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SKAP1Q86WV1 359 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM199Q8N511 208 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM87BQ96K49 555 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 ANTXR2P58335 489 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 CHMP4BP1P59074 171 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 PSMC6P62333 389 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 TROAPQ12815 778 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.154e-7■□□□□ 10.8
ANKRD54-211ENST00000609454 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MTA3Q9BTC8 594 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 KPNA6O60684 536 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 DDAH1O94760 285 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 POLR2MP0CAP2 368 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 GNAQP50148 359 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MFSD5Q6N075 450 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 COPS5Q92905 334 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MTMR8Q96EF0 704 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MYL10Q9BUA6 226 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 LY9Q9HBG7 655 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 PXMP2Q9NR77 195 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 COL20A1Q9P218 1284 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 TBX21Q9UL17 535 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 CDC45O75419 566 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 NR3C2P08235 984 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 CALM1P0DP23 149 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 CALM2P0DP24 149 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 CALM3P0DP25 149 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 Q7L0L9 218 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MAP3K14Q99558 947 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 HIPK3Q9H422 1215 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 GH1P01241 217 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 HSD17B4P51659 736 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 NECTIN1Q15223 517 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 LY6KQ17RY6 165 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CD4P01730 458 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CUL5Q93034 780 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 LCTP09848 1927 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 LTBP2Q14767 1821 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CYTH3O43739 400 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 ARIH2O95376 493 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CYP2C18P33260 490 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 NOD1Q9Y239 953 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SZT2Q5T011 3432 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 GRIN2DO15399 1336 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 A6NJR5 290 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 B4GALT4O60513 344 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CSF2RAP15509 400 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CCND2P30279 289 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 LIFRP42702 1097 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 EPHB4P54760 987 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 AFG1LQ8WV93 481 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM161BQ96MY7 647 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 NEK1Q96PY6 1258 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 OPLAHO14841 1288 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 RXRAP19793 462 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 FGD1P98174 961 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms