RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 MYH8P13535 1937 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 GH2P01242 217 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 ASGR1P07306 291 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 FGRP09769 529 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SHMT1P34896 483 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 ANAPC15P60006 121 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 HAND2P61296 217 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 NKX3-2P78367 333 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 PTH1RQ03431 593 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 PKN1Q16512 942 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 EDAQ92838 391 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SLC9A7Q96T83 725 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 MTA3Q9BTC8 594 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.12□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 LAMA4Q16363 1823 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 LCHNA4D1U4 455 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 ZBBXA8MT70 800 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SLC27A2O14975 620 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 FOXP2O15409 715 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TTLL1O95922 423 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 CYP21A2P08686 494 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 MCM5P33992 734 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 HSPA4P34932 840 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 FGD1P98174 961 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TFAP4Q01664 338 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 ICA1Q05084 483 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 NECTIN1Q15223 517 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TMTC2Q8N394 836 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 ACER1Q8TDN7 264 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TTC14Q96N46 770 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 MROH8Q9H579 483 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 GOPCQ9HD26 462 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM221A6NGB7 291 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 E7EWF7 191 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 M0R296 226 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 B4GALT4O60513 344 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 PGK2P07205 417 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 PFKMP08237 780 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 RASA1P20936 1047 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 GJA9P57773 515 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SCLYQ96I15 445 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM87BQ96K49 555 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 USP26Q9BXU7 913 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 IL25Q9H293 177 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 NYAP2Q9P242 653 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TRPC6Q9Y210 931 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.1□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 KDM4AO75164 1064 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 PRDM1O75626 825 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 FCER1AP12319 257 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 AKR1B1P15121 316 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 NBL1P41271 181 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SEPT2Q15019 361 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 C8orf34Q49A92 452 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 DGKHQ86XP1 1220 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 RNF135Q8IUD6 432 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 FBXL6Q8N531 539 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 COL26A1Q96A83 441 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 NEK1Q96PY6 1258 aa9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ZNF548-208ENST00000597576 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms