RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573989.1

TRAPPC1-206, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-206ENST00000573989 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 RARBP10826 455 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 XBP1P17861 261 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 GNA11P29992 359 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 MCM2P49736 904 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 ADCY7P51828 1080 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 STXBP2Q15833 593 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 ME3Q16798 604 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 WASF1Q92558 559 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 GTF3C6Q969F1 213 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 C6orf50Q9HD87 102 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 PXMP2Q9NR77 195 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 POTEFA5A3E0 1075 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 SMCO2A6NFE2 343 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 STXBP3O00186 592 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 MCTP2Q6DN12 878 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 TRPV1Q8NER1 839 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 BICD2Q8TD16 824 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 COL20A1Q9P218 1284 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 ASTN1O14525 1302 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 STK36Q9NRP7 1315 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 ESYT2A0FGR8 921 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 MEIS2O14770 477 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 NR3C2P08235 984 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 EDNRBP24530 442 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 PKN1Q16512 942 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 SPC25Q9HBM1 224 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC1-206ENST00000573989 PPFIA3O75145 1194 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 STAM2O75886 525 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 CCND2P30279 289 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 PGM5Q15124 567 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 IFFO2Q5TF58 517 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 NECAB1Q8N987 351 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 SCFD2Q8WU76 684 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 LARGE1O95461 756 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 NLRP5P59047 1200 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 TNFAIP2Q03169 654 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 AP3B2Q13367 1082 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 TTLL4Q14679 1199 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 LHX8Q68G74 356 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 GALNT17Q6IS24 598 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 KATNBL1Q9H079 304 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 UBE2SQ16763 222 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 GNPTABQ3T906 1256 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 ANO1Q5XXA6 986 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 RNF180Q86T96 592 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 Q9Y3F1 56 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 KBTBD13C9JR72 458 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1-206ENST00000573989 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms