RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 EDNRBP24530 442 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 PBX2P40425 430 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 TNKSO95271 1327 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 TRDNQ13061 729 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO11Q86XK2 927 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 RETREG2Q8NC44 543 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 NOD1Q9Y239 953 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 A6NJR5 290 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBBXA8MT70 800 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 PFKMP08237 780 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP2C9P11712 490 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 CHMP4BP1P59074 171 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 STXBP2Q15833 593 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 SCLYQ96I15 445 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 IWS1Q96ST2 819 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 ACTN1P12814 892 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 COPS5Q92905 334 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 RMDN3Q96TC7 470 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 LCTP09848 1927 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 GH1P01241 217 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D5Q92609 795 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 AMNQ9BXJ7 453 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 CFBP00751 764 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 BFSP2Q13515 415 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 ERICH2A1L162 156 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 RFC2P35250 354 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAF1Q13077 416 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 PPM1EQ8WY54 764 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 KLRF2D3W0D1 207 aa22.42■■□□□ 1.18
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SH3BP2-220ENST00000511663 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 IGFBP4P22692 258 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 LY6KQ17RY6 165 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 CHST3Q7LGC8 479 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 AFG1LQ8WV93 481 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 PITPNM1O00562 1244 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 ARIH2O95376 493 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 NR3C2P08235 984 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 IQCF3P0C7M6 154 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 PTGISQ16647 500 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 DGKDQ16760 1214 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC22Q5TAA0 569 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 COL20A1Q9P218 1284 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMA4Q16363 1823 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB5O15062 677 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 MMP3P08254 477 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 RABGGTBP53611 331 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMC2Q13753 1193 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PXMP2Q9NR77 195 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 SEC23AQ15436 765 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF28PB7ZC32 967 aa22.37■■□□□ 1.17
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