RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275		B4DLN1	442 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PIK3CD	O00329	1044 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	IWS1	Q96ST2	819 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	STXBP3	O00186	592 aa		29.72	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	SCRN1	Q12765	414 aa		29.72	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		29.72	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	BARHL2	Q9NY43	387 aa		29.72	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PFKFB2	O60825	505 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	NR3C2	P08235	984 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	SCG2	P13521	617 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PGK1	P00558	417 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	SMPD1	P17405	629 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	NAPA	P54920	295 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	TNFAIP2	Q03169	654 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	LRRC41	Q15345	812 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	CUL5	Q93034	780 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	LARGE1	O95461	756 aa		29.69	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	ME3	Q16798	604 aa		29.69	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		29.69	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	IL31RA	Q8NI17	732 aa		29.69	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	BACH2	Q9BYV9	841 aa		29.69	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	DNM1L	O00429	736 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	ADAMTS4	O75173	837 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	COL6A1	P12109	1028 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	PTGS1	P23219	599 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	PGM5	Q15124	567 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	STXBP2	Q15833	593 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	UBE2S	Q16763	222 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	CPLX1	O14810	134 aa		29.67	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	29.67	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	29.67	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		29.67	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		29.67	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	29.67	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		29.67	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		29.67	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	SMCO2	A6NFE2	343 aa		29.66	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	29.66	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	29.66	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	29.66	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	NECAB1	Q8N987	351 aa		29.66	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		29.66	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	ALPK3	Q96L96	1907 aa		29.65	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	MYADML2	A6NDP7	307 aa		29.65	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	GJA9	P57773	515 aa		29.65	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		29.65	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		29.65	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	CTAGE5	O15320	804 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	CTDNEP1	O95476	244 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	ADCY7	P51828	1080 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	NKX3-2	P78367	333 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	RNF180	Q86T96	592 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	SCFD2	Q8WU76	684 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275		Q9Y3F1	56 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TTC3-223	ENST00000492275	DTNB	O60941	627 aa		29.63	■■■□□ 2.33
TTC3-223	ENST00000492275	RGS20	O76081	388 aa		29.63	■■■□□ 2.33
TTC3-223	ENST00000492275	ARIH2	O95376	493 aa		29.63	■■■□□ 2.33
TTC3-223	ENST00000492275	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	29.63	■■■□□ 2.33
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		29.63	■■■□□ 2.33
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		29.63	■■■□□ 2.33
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		29.63	■■■□□ 2.33
TTC3-223	ENST00000492275	ESYT2	A0FGR8	921 aa		29.62	■■■□□ 2.33
TTC3-223	ENST00000492275	KBTBD13	C9JR72	458 aa		29.62	■■■□□ 2.33

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