RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	GNAQ	P50148	359 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGA7	Q13683	1181 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL4	Q14679	1199 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R5B	Q15173	497 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD5	Q6N075	450 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CALM1	P0DP23	149 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CALM2	P0DP24	149 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CALM3	P0DP25	149 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	ANTXR2	P58335	489 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	RMDN3	Q96TC7	470 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		20.04	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		20.03	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	20.03	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	BEX3	Q00994	111 aa		20.03	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	FPGS	Q05932	587 aa		20.03	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		20.03	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		20.03	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		20.03	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC27A2	O14975	620 aa		20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGB8	P26012	769 aa		20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	20.02	■□□□□ 0.8	2e-10	■■■■□ 20.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM199	Q8N511	208 aa		20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D5	Q92609	795 aa		20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	LY9	Q9HBG7	655 aa		20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		20.02	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	LCT	P09848	1927 aa		20.02	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	OPLAH	O14841	1288 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	NR3C2	P08235	984 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	TGFB3	P10600	412 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT32	Q14532	448 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	SHH	Q15465	462 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	PXMP2	Q9NR77	195 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIN2D	O15399	1336 aa		20.01	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	PRC1	O43663	620 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	CYTH3	O43739	400 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	STAM2	O75886	525 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	CFB	P00751	764 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424		Q7L0L9	218 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	COL20A1	Q9P218	1284 aa		20	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	GH1	P01241	217 aa		19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2M	P0CAP2	368 aa		19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB123	Q8N688	67 aa		19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGS	Q96S52	555 aa		19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC69	A6NI79	296 aa		19.98	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		19.98	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	19.98	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	SENP2	Q9HC62	589 aa		19.98	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		19.98	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH6	P13533	1939 aa		19.98	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	PIK3CD	O00329	1044 aa		19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	RCAN1	P53805	252 aa		19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMC2	Q13753	1193 aa		19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	CHST3	Q7LGC8	479 aa		19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	SESTD1	Q86VW0	696 aa		19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	19.97	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	19.96	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	19.96	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	RASIP1	Q5U651	963 aa		19.96	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	HOMER1	Q86YM7	354 aa		19.96	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	NEK1	Q96PY6	1258 aa		19.96	■□□□□ 0.79

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