RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 TMX3Q96JJ7 454 aa24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-212ENST00000472427 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-212ENST00000472427 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-212ENST00000472427 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-212ENST00000472427 PXMP2Q9NR77 195 aa24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-212ENST00000472427 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-212ENST00000472427 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF3AQ9Y496 699 aa24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-212ENST00000472427 LCTP09848 1927 aa24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-212ENST00000472427 MSCO60682 206 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 CYBAP13498 195 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIM29Q14134 588 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 VTA1Q9NP79 307 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 COL20A1Q9P218 1284 aa24.95■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 MEIS2O14770 477 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 IGHA2P01877 340 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 AP3B2Q13367 1082 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 ACVR2BQ13705 512 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 UBE2SQ16763 222 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 GALNT17Q6IS24 598 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 MORC4Q8TE76 937 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 ALG1Q9BT22 464 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 HTTP42858 3142 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 ASTN1O14525 1302 aa24.93■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 CCND2P30279 289 aa24.93■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 MTFR1Q15390 333 aa24.93■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 STXBP2Q15833 593 aa24.93■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 SEPT4O43236 478 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 JAK2O60674 1132 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 AKR1A1P14550 325 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 CAPN2P17655 700 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 EDNRBP24530 442 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 ST3GAL1Q11201 340 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 HSCBQ8IWL3 235 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 GJB1P08034 283 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 NR3C2P08235 984 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 PGM5Q15124 567 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 AIFM3Q96NN9 605 aa24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 DEFB118Q96PH6 123 aa24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 STAM2O75886 525 aa24.89■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 TRPV1Q8NER1 839 aa24.89■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 SNX21Q969T3 373 aa24.89■■□□□ 1.58
RALGPS1-212ENST00000472427 MCM3APO60318 1980 aa24.89■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 RARBP10826 455 aa24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 GNPTABQ3T906 1256 aa24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 SCFD2Q8WU76 684 aa24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 ANO3Q9BYT9 981 aa24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 BLIDQ8IZY5 108 aa24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 C8orf76Q96K31 380 aa24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 GJA8P48165 433 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 TTLL4Q14679 1199 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 KATNBL1Q9H079 304 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 SPC25Q9HBM1 224 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM260Q9NX78 707 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 DTNBO60941 627 aa24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms