RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RTN1Q16799 776 aa22.85■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCFD2Q8WU76 684 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL20A1Q9P218 1284 aa22.85■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYN1P17600 705 aa22.84■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BRF1Q92994 677 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNX17Q15036 470 aa22.81■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.81■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.81■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.8■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.79■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 TLE2Q04725 743 aa22.78■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 CTAGE5O15320 804 aa22.77■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 PGM5Q15124 567 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXL16Q8N461 479 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.77■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.77■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIK3CDO00329 1044 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GH1P01241 217 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYL3P08590 195 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLTBP09497 229 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NAPAP54920 295 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.74■■□□□ 1.23
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