RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 SENP2Q9HC62 589 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TBX21Q9UL17 535 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.2■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 PRC1O43663 620 aa24.2■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.2■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CHST3Q7LGC8 479 aa24.2■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.2■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.2■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 A6NJR5 290 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 OPLAHO14841 1288 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CYTH3O43739 400 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CDC45O75419 566 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 TIMP1P01033 207 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CALM1P0DP23 149 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CALM2P0DP24 149 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CALM3P0DP25 149 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 ITGA7Q13683 1181 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 COL20A1Q9P218 1284 aa24.19■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CFBP00751 764 aa24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CD4P01730 458 aa24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 LRCH3Q96II8 777 aa24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 PIGSQ96S52 555 aa24.18■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 ITGB8P26012 769 aa24.17■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 MFSD5Q6N075 450 aa24.17■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.17■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 PXMP2Q9NR77 195 aa24.17■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC69A6NI79 296 aa24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 NR3C2P08235 984 aa24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 POLR2MP0CAP2 368 aa24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 FPGSQ05932 587 aa24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 HOMER1Q86YM7 354 aa24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 GRIN2DO15399 1336 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 KRT32Q14532 448 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 SHHQ15465 462 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 LAMA3Q16787 3333 aa24.14■■□□□ 1.46
SIKE1-204ENST00000462123 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.14■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.14■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 NEK1Q96PY6 1258 aa24.14■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.13■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 GH1P01241 217 aa24.13■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 TGFB3P10600 412 aa24.13■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM199Q8N511 208 aa24.13■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.13■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 ARIH2O95376 493 aa24.12■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 PTGS1P23219 599 aa24.12■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 SKAP1Q86WV1 359 aa24.12■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.12■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 STAM2O75886 525 aa24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 FANCBQ8NB91 859 aa24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 LCTP09848 1927 aa24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 MCM3APO60318 1980 aa24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 PIK3CDO00329 1044 aa24.1■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 NEFLP07196 543 aa24.1■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 MYL3P08590 195 aa24.1■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 ARHGAP1Q07960 439 aa24.1■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 LAMC2Q13753 1193 aa24.1■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 PGM5Q15124 567 aa24.1■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 KCNB2Q92953 911 aa24.1■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 CCND2P30279 289 aa24.09■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 RCAN1P53805 252 aa24.09■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 LY6KQ17RY6 165 aa24.09■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.09■■□□□ 1.45
SIKE1-204ENST00000462123 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms