RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431405.1

USP9YP31-201, Transcript of USP9Y pseudogene 31, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP31, Length 881 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP31-201ENST00000431405 COPS5Q92905 334 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 IFT140Q96RY7 1462 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CHD1O14646 1710 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 SCG5P05408 212 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 THBDP07204 575 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 NTRK3Q16288 839 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 TKFCQ3LXA3 575 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 NSMFQ6X4W1 530 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 EBF1Q9UH73 591 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 BLACEA4D250 179 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CDC45O75419 566 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 BMP7P18075 431 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 HOXC12P31275 282 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 ECI1P42126 302 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 KCNJ6P48051 423 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 FRS2Q8WU20 508 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CDC6Q99741 560 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 GCM1Q9NP62 436 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 MAP4K2Q12851 820 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 MBLAC2Q68D91 279 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 HOMER1Q86YM7 354 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CCDC103Q8IW40 242 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 FITM1A5D6W6 292 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 ASMTLO95671 621 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 PLS3P13797 630 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 SYN1P17600 705 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 KRTAP10-2P60368 255 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 OXR1Q8N573 874 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 APPBP2Q92624 585 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CCDC140Q96MF4 163 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CLEC1BQ9P126 229 aa6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 KDM6BO15054 1643 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 TRIM13O60858 407 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 HSD3B2P26439 372 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 SEPHS1P49903 392 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 NFIXQ14938 502 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CXorf38Q8TB03 319 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP9YP31-201ENST00000431405 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms