RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 ARIH2O95376 493 aa16.8■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 RFC2P35250 354 aa16.8■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 HERC6Q8IVU3 1022 aa16.8■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 IL27Q8NEV9 243 aa16.8■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 SLC9A7Q96T83 725 aa16.8■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.8■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 FGAP02671 866 aa16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 SNHG28P0DPA3 235 aa16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 PDHBP11177 359 aa16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 CALML3P27482 149 aa16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 GRB10Q13322 594 aa16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 AAK1Q2M2I8 961 aa16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 ACTN1P12814 892 aa16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 ZNF543Q08ER8 600 aa16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 TCTN1Q2MV58 587 aa16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 SCFD2Q8WU76 684 aa16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 TBC1D5Q92609 795 aa16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 KAT2BQ92831 832 aa16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 LCHNA4D1U4 455 aa16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 KPNA6O60684 536 aa16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 TXNP10599 105 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 MX1P20591 662 aa16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 PDE4DQ08499 809 aa16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 PPP2R5BQ15173 497 aa16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 RETREG2Q8NC44 543 aa16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 DNERQ8NFT8 737 aa16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 LRFN3Q9BTN0 628 aa16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 COG5Q9UP83 839 aa16.77■□□□□ 0.28
NFE4-201ENST00000420058 WDR19Q8NEZ3 1342 aa16.76■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 MUC6Q6W4X9 2439 aa16.76■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 RGS22Q8NE09 1264 aa16.76■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 FAM122AQ96E09 287 aa16.76■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 CD320Q9NPF0 282 aa16.76■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 C11orf16Q9NQ32 467 aa16.76■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 PTPRSQ13332 1948 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 BAIAP3O94812 1187 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 BFSP2Q13515 415 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 PTGISQ16647 500 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 SESTD1Q86VW0 696 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 AFG1LQ8WV93 481 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 HLA-CQ95604 372 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 FAM227BQ96M60 508 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 CPVLQ9H3G5 476 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 TRIOO75962 3097 aa16.75■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 A0A0D9SFI3 127 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 KIF28PB7ZC32 967 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 NBNO60934 754 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 CXCL10P02778 98 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 ARHGAP1Q07960 439 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 RBL2Q08999 1139 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 LY6KQ17RY6 165 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 TTC14Q96N46 770 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 COL20A1Q9P218 1284 aa16.74■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 MMP3P08254 477 aa16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 DEFB103AP81534 67 aa16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 CAGE1Q8TC20 777 aa16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 EVI5LQ96CN4 794 aa16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 TOMM22Q9NS69 142 aa16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 PNMA2Q9UL42 364 aa16.73■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 RAD50Q92878 1312 aa16.72■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 SELPP16109 830 aa16.72■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 HAND2P61296 217 aa16.72■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa16.72■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16.72■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 WNT8BQ93098 351 aa16.72■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.72■□□□□ 0.27
NFE4-201ENST00000420058 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms