RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 RNF135Q8IUD6 432 aa22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 MKL1Q969V6 931 aa22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 INSL6Q9Y581 213 aa22.86■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 KPNA6O60684 536 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 TTLL1O95922 423 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 SNAP25P60880 206 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 IKBKEQ14164 716 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 COL19A1Q14993 1142 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 CLUL1Q15846 466 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 RPAINQ86UA6 219 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 EDAQ92838 391 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM221A6NGB7 291 aa22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 M0R296 226 aa22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 EPC2Q52LR7 807 aa22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 COPS5Q92905 334 aa22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.84■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 TRIOO75962 3097 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 A6NJR5 290 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 RBL2Q08999 1139 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 GPM6BQ13491 265 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 SBK1Q52WX2 424 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 SAMD11Q96NU1 681 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 BCL11AQ9H165 835 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1-202ENST00000418601 PRDM1O75626 825 aa22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 CKBP12277 381 aa22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC1A4P43007 532 aa22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 UBE3CQ15386 1083 aa22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 PKN1Q16512 942 aa22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 C5orf42Q9H799 3197 aa22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 H3BNC9 293 aa22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 CEP85Q6P2H3 762 aa22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 GMCL1Q96IK5 515 aa22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 MBTPS2O43462 519 aa22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 AMHP03971 560 aa22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 LTBRP36941 435 aa22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 SESTD1Q86VW0 696 aa22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 COL4A6Q14031 1691 aa22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 KCTD1Q719H9 257 aa22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 SCFD2Q8WU76 684 aa22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 STXBP3O00186 592 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 MCCP23508 829 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 PLXNA3P51805 1871 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 PDE4DQ08499 809 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 FBXO11Q86XK2 927 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 FBXL6Q8N531 539 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 NFIBO00712 420 aa22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 LGR5O75473 907 aa22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 YME1L1Q96TA2 773 aa22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1-202ENST00000418601 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1-202ENST00000418601 NCK2O43639 380 aa22.76■■□□□ 1.23
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