RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 REV3LO60673 3130 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 RFXAPO00287 272 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 KPNA6O60684 536 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 FGAP02671 866 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNQ1P51787 676 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 CERS4Q9HA82 394 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 INCENPQ9NQS7 918 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF28PB7ZC32 967 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 PITPNM1O00562 1244 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 NFIBO00712 420 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC16A2P36021 539 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOVP48745 357 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.195e-6■■■□□ 14.7
TRAPPC3-204ENST00000373166 COG5Q9UP83 839 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRANK1O15050 2925 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 ORC4O43929 436 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 IQCF3P0C7M6 154 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDE4DQ08499 809 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP2R5BQ15173 497 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 TOMM22Q9NS69 142 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 PNMA2Q9UL42 364 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 LAMA4Q16363 1823 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 NCOR1O75376 2440 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 CALML3P27482 149 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 BFSP2Q13515 415 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCFD2Q8WU76 684 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOD1Q9Y239 953 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 A6NJR5 290 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 HAND2P61296 217 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAP1Q03518 808 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 GBF1Q92538 1859 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 EPOPA6NHQ4 379 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 B4DLN1 442 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 BAIAP3O94812 1187 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 FGRP09769 529 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT40Q6A162 431 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNERQ8NFT8 737 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 HLA-CQ95604 372 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF213O14771 459 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 EDNRBP24530 442 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 TLL1O43897 1013 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNJ6P48051 423 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHMP4BP1P59074 171 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 COPS5Q92905 334 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGEF15O94989 841 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEFLP07196 543 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRB10Q13322 594 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTGISQ16647 500 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 CAGE1Q8TC20 777 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDHBP11177 359 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHMLP26374 656 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 NT5C2P49902 561 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 ESR2Q92731 530 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTC14Q96N46 770 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL25Q9H293 177 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEDD4P46934 1319 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 LCTP09848 1927 aa22.4■■□□□ 1.18
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