RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GBP1P32455 592 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PIGBQ92521 554 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 H7C1W4 665 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 RASSF2P50749 326 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 USP14P54578 494 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 EHHADHQ08426 723 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD1Q719H9 257 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PIGSQ96S52 555 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 DPH5Q9H2P9 285 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 NACC1Q96RE7 527 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 MYL7Q01449 175 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PPARDQ03181 441 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 TFDP1Q14186 410 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 MED10Q9BTT4 135 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 RASGRF1Q13972 1273 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PTPROQ16827 1216 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 RABGGTAQ92696 567 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 CDHR1Q96JP9 859 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 NAA25Q14CX7 972 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SORBS3O60504 671 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 BFSP1Q12934 665 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 MED4Q9NPJ6 270 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 RASSF7Q02833 373 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 MGARPQ8TDB4 240 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 RILPQ96NA2 401 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 CCNA1P78396 465 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 APBA1Q02410 837 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R5CQ13362 524 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PASKQ96RG2 1323 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 KDM5CP41229 1560 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 THAP12O43422 761 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SLC16A2P36021 539 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 KIF11P52732 1056 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 GPR162Q16538 588 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 DGKHQ86XP1 1220 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL14Q9P2G3 628 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L8P0C7I0 530 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3CAP42336 1068 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 GNGT1P63211 74 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ANO3Q9BYT9 981 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 FAM81BQ96LP2 452 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ACCSQ96QU6 501 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 GDF11O95390 407 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ATF2P15336 505 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 CCNE1P24864 410 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT2Q15019 361 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35F6Q8N357 371 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM11Q96F44 468 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 LPXNO60711 386 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 STAT2P52630 851 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 RESTQ13127 1097 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 GRAPQ13588 217 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD6Q15008 389 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 COA7Q96BR5 231 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM206Q9H813 350 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms