RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PXMP2Q9NR77 195 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 IGHA2P01877 340 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 GNA11P29992 359 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 HSCBQ8IWL3 235 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 ARMC5Q96C12 935 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 FOSBP53539 338 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF333Q96JL9 665 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 B4DLN1 442 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PDE4DQ08499 809 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 MTFR1Q15390 333 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.6■■□□□ 1.69
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HOXD4-201ENST00000306324 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 BICD2Q8TD16 824 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM260Q9NX78 707 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTS3O15072 1205 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 CNGA1P29973 690 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM29Q14134 588 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PGBD1Q96JS3 809 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 IWS1Q96ST2 819 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 RPTORQ8N122 1335 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 NR3C2P08235 984 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 CYBAP13498 195 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 CCL5P13501 91 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 EDNRBP24530 442 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 CUL4AQ13619 759 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PGM5Q15124 567 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 TRPV1Q8NER1 839 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 MORC4Q8TE76 937 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 ABHD8Q96I13 439 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 ACVR2BQ13705 512 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 IL31RAQ8NI17 732 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 RNF208Q9H0X6 261 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD4-201ENST00000306324 GJB2P29033 226 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 AP3B2Q13367 1082 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 STXBP2Q15833 593 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT17Q6IS24 598 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 BLIDQ8IZY5 108 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 C8orf76Q96K31 380 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 ANO3Q9BYT9 981 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 KIF3AQ9Y496 699 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 GUCY1B3Q02153 619 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 CCND2P30279 289 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 NPY5RQ15761 445 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 KRT40Q6A162 431 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 KATNBL1Q9H079 304 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 VTA1Q9NP79 307 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 MCTP2Q6DN12 878 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 SEPT4O43236 478 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 PDGFCQ9NRA1 345 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
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