RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 POLR2MP0CAP2 368 aa21.92■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 CPT1AP50416 773 aa21.92■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 TTLL4Q14679 1199 aa21.92■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.92■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.92■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 ARVCFO00192 962 aa21.91■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 KPNA6O60684 536 aa21.91■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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MALSU1-201ENST00000287543 CDK7P50613 346 aa21.91■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 BEX3Q00994 111 aa21.91■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 TDHQ8IZJ6 230 aa21.91■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.91■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 KIAA0355O15063 1070 aa21.9■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.9■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 FANCBQ8NB91 859 aa21.9■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.9■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 MYL10Q9BUA6 226 aa21.9■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 PXMP2Q9NR77 195 aa21.9■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.9■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 COL20A1Q9P218 1284 aa21.9■■□□□ 1.1
MALSU1-201ENST00000287543 OPLAHO14841 1288 aa21.89■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 NR3C2P08235 984 aa21.89■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.89■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 RAG1P15918 1043 aa21.88■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.88■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 RASEFQ8IZ41 740 aa21.88■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 KCNB2Q92953 911 aa21.88■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 FRMPD3Q5JV73 1810 aa21.87■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.87■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 FAAP100Q0VG06 881 aa21.87■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 ITGA7Q13683 1181 aa21.87■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.87■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.87■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.87■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.87■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 A6NJR5 290 aa21.86■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.86■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.86■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.86■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 PSMA5P28066 241 aa21.85■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 MICU3Q86XE3 530 aa21.85■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.84■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.84■■□□□ 1.09
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MALSU1-201ENST00000287543 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.83■■□□□ 1.09
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.82■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 ARIH2O95376 493 aa21.82■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 CD4P01730 458 aa21.82■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.82■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 PTGS1P23219 599 aa21.82■■□□□ 1.08
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MALSU1-201ENST00000287543 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.82■■□□□ 1.08
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