RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNKSO95271 1327 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EPOPA6NHQ4 379 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC1A4P43007 532 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NOVP48745 357 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NT5C2P49902 561 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KRT40Q6A162 431 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC9A7Q96T83 725 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VTA1Q9NP79 307 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 B4E1Z4 1266 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KDM4AO75164 1064 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KRT23Q9C075 422 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.15■■□□□ 1.14
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CASC1Q6TDU7 716 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NSMFQ6X4W1 530 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAP4K1Q92918 833 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GMCL1Q96IK5 515 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTMR7Q9Y216 660 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TLL1O43897 1013 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 IQCA1Q86XH1 822 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HLA-CQ95604 372 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTC14Q96N46 770 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIF28PB7ZC32 967 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDC45O75419 566 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP21A2P08686 494 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RFC2P35250 354 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAP1Q03518 808 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCTD1Q719H9 257 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.12■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RETREG2Q8NC44 543 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC96Q2M329 555 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DGKHQ86XP1 1220 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DCAF4Q8WV16 495 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 REV3LO60673 3130 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRB10Q13322 594 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCN5AQ14524 2016 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PITPNM1O00562 1244 aa22.08■■□□□ 1.13
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 E7EWF7 191 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR37L1O60883 481 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ICAM1P05362 532 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BFSP2Q13515 415 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NCOA7Q8NI08 942 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KAT14Q9H8E8 782 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NOD1Q9Y239 953 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNJ6P48051 423 aa22.06■■□□□ 1.12
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