RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C SSA2P10592 639 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C ISM1P48526 1002 aa9.01□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C YPR015CQ12531 247 aa9.01□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C GLN1P32288 370 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C NPL4P33755 580 aa8.99□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C YNL115CP53925 644 aa8.99□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C MMP1Q12372 583 aa8.98□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C KEX2P13134 814 aa8.97□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PFA4YOL003C SCJ1P25303 377 aa8.96□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C ERF2Q06551 359 aa8.96□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-DR4O74302 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-AP0CX57 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-PR1P0CX58 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-ORP0CX59 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-PR2P0CX60 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-DR5P0CX65 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-ER2P0CX66 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-GR3P0CX67 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-LR1P0CX68 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-MR2P0CX69 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-JR2P47099 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-DR1Q03856 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-BRQ12217 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-NL2Q12470 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TY1A-GR2Q12485 440 aa8.94□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C ESS1P22696 170 aa8.93□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C TFB3Q03290 321 aa8.93□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C SEC2P17065 759 aa8.92□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C SLY41P22215 453 aa8.91□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C GCD11P32481 527 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C HGH1P48362 394 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C BRL1P38770 471 aa8.9□□□□□ -0.98
PFA4YOL003C YJU3P28321 313 aa8.89□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C TAF7Q05021 590 aa8.89□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C AGE1Q04412 482 aa8.88□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C RSC30P38781 883 aa8.87□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C RAD59Q12223 238 aa8.87□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C VRP1P37370 817 aa8.86□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data8.86□□□□□ -0.99not detected
PFA4YOL003C SAS4Q04003 481 aa8.85□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C LAM6Q08001 693 aa8.85□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C PKC1P24583 1151 aa8.84□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C BCK2P33306 851 aa8.84□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C PUS6P53294 404 aa8.84□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C TUB4P53378 473 aa8.84□□□□□ -0.99
PFA4YOL003C TRM1P15565 570 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PFA4YOL003C ARG8P18544 423 aa8.81□□□□□ -1
PFA4YOL003C GYP1Q08484 637 aa8.81□□□□□ -1
PFA4YOL003C PAC1P39946 494 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PFA4YOL003C RRN7P40992 514 aa8.79□□□□□ -1
PFA4YOL003C CSE4P36012 229 aa8.78□□□□□ -1
PFA4YOL003C PAT1P25644 796 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C TBF1Q02457 562 aa8.77□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C YBL036CP38197 257 aa8.76□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C XDJ1P39102 459 aa8.75□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C RPA14P50106 137 aa8.75□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C YDL206WQ12424 762 aa8.75□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C SDH2P21801 266 aa8.73□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C YPR097WQ06839 1073 aa8.73□□□□□ -1.01
PFA4YOL003C PDC1P06169 563 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C MOD5P07884 428 aa8.7□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C TPD3P31383 635 aa8.7□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C BIO2P32451 375 aa8.7□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C YJL007CP47080 104 aa8.7□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C KXD1P53158 218 aa8.7□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C ALR1Q08269 859 aa8.7□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C BIM1P40013 344 aa8.69□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C HXT10P43581 546 aa8.67□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C RLF2Q12495 606 aa8.67□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C ATG32P40458 529 aa8.66□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C NAF1P53919 492 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C ERG12P07277 443 aa8.65□□□□□ -1.02
PFA4YOL003C SUP45P12385 437 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PFA4YOL003C RRD1P40454 393 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PFA4YOL003C TIF1P10081 395 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PFA4YOL003C YEL077CQ3E7X8 1277 aa8.61□□□□□ -1.03
PFA4YOL003C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PFA4YOL003C CST6P40535 587 aa8.6□□□□□ -1.03
PFA4YOL003C YNL108CP53929 270 aa8.6□□□□□ -1.03
PFA4YOL003C FIG4P42837 879 aa8.59□□□□□ -1.03
PFA4YOL003C BDP1P46678 594 aa8.59□□□□□ -1.03
PFA4YOL003C AMS1P22855 1083 aa8.58□□□□□ -1.04
PFA4YOL003C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PFA4YOL003C ENO2P00925 437 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PFA4YOL003C VAC17P25591 423 aa8.57□□□□□ -1.04
PFA4YOL003C TEC1P18412 486 aa8.56□□□□□ -1.04
PFA4YOL003C YPR084WQ06821 456 aa8.56□□□□□ -1.04
PFA4YOL003C MCM16Q12262 181 aa8.56□□□□□ -1.04
PFA4YOL003C RIM21P48565 533 aa8.54□□□□□ -1.04
PFA4YOL003C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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