RNA–Protein interactions for RNA: YKL133C

YKL133C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL133C, Length 1,392 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL133CYKL133C RTG3P38165 486 aa11.2□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C FKH1P40466 484 aa11.19□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C BCK1Q01389 1478 aa11.19□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C TYS1P36421 394 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C IPL1P38991 367 aa11.18□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C ALD4P46367 519 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C TAF8Q03750 510 aa11.16□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
YKL133CYKL133C RAD9P14737 1309 aa11.14□□□□□ -0.63
YKL133CYKL133C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
YKL133CYKL133C YDL144CQ07589 356 aa11.14□□□□□ -0.63
YKL133CYKL133C TRK1P12685 1235 aa11.12□□□□□ -0.63
YKL133CYKL133C RPC31P17890 251 aa11.12□□□□□ -0.63
YKL133CYKL133C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
YKL133CYKL133C URN1Q06525 465 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
YKL133CYKL133C SNF2P22082 1703 aa11.1□□□□□ -0.63
YKL133CYKL133C YGL015CP33199 130 aa11.1□□□□□ -0.63
YKL133CYKL133C SUI2P20459 304 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C YML133CQ03099 1374 aa11.07□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C YLL067CQ07888 1374 aa11.07□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C YLL066CQ99208 1374 aa11.07□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C FPR3P38911 411 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C IME2P32581 645 aa11.05□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C CAB1Q04430 367 aa11.05□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C OPY1P38271 328 aa11.04□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C HAP1P0CE41 1502 aa11.04□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C BNI1P41832 1953 aa11.04□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C NAP1P25293 417 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C MPP10P47083 593 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
YKL133CYKL133C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data11.03□□□□□ -0.64not detected
YKL133CYKL133C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
YKL133CYKL133C ABP1P15891 592 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
YKL133CYKL133C ITT1Q04638 464 aa11□□□□□ -0.65
YKL133CYKL133C YIR014WP40570 242 aa10.97□□□□□ -0.65
YKL133CYKL133C DNF3Q12674 1656 aa10.96□□□□□ -0.65
YKL133CYKL133C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
YKL133CYKL133C CDC27P38042 758 aa10.95□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C SAP155P43612 1002 aa10.95□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C KRE5P22023 1365 aa10.95□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C PSK1P31374 1356 aa10.95□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C TAP42Q04372 366 aa10.92□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C RAD2P07276 1031 aa10.91□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C KAR2P16474 682 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C CLC1P17891 233 aa10.9□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C PRD1P25375 712 aa10.9□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C SPT21P35209 758 aa10.9□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C THI22Q06490 572 aa10.9□□□□□ -0.66
YKL133CYKL133C PPH3P32345 308 aa10.89□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C YIL092WP40497 633 aa10.89□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C RCM1P53972 490 aa10.89□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C TPD3P31383 635 aa10.88□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C YPR148CQ06523 435 aa10.88□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C AUS1Q08409 1394 aa10.87□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data10.87□□□□□ -0.67not detected
YKL133CYKL133C MRX12P47084 519 aa10.87□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C SIR4P11978 1358 aa10.86□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C EAF7P53911 425 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C HIM1Q06674 414 aa10.86□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C PDI1P17967 522 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C DAL5P15365 543 aa10.84□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C USO1P25386 1790 aa10.84□□□□□ -0.67
YKL133CYKL133C POL32P47110 350 aa10.83□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C YRF1-4O13559 1382 aa10.83□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C GRX4P32642 244 aa10.82□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C PAP2P53632 584 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C RIA1P53893 1110 aa10.81□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C RTT109Q07794 436 aa10.81□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C SNF7P39929 240 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C CPS1P27614 576 aa10.79□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C CSE4P36012 229 aa10.79□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C RTF1P53064 558 aa10.79□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
YKL133CYKL133C PCT1P13259 424 aa10.77□□□□□ -0.69
YKL133CYKL133C APC1P53886 1748 aa10.76□□□□□ -0.69
YKL133CYKL133C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
YKL133CYKL133C ROX1P25042 368 aa10.74□□□□□ -0.69
YKL133CYKL133C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
YKL133CYKL133C PRP43P53131 767 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
YKL133CYKL133C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
YKL133CYKL133C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C CAB3P36076 571 aa10.68□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C GAS4Q08271 471 aa10.68□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C VPS24P36095 224 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C MAK10Q02197 733 aa10.67□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C TRP5P00931 707 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C GYP7P48365 746 aa10.66□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C DSD1P53095 428 aa10.66□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C DJP1P40564 432 aa10.65□□□□□ -0.7
YKL133CYKL133C YNL050CP53952 270 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms