RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 TRIM52Q96A61 297 aa26.48■■□□□ 1.83
CLN8-211ENST00000636934 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CLN8-211ENST00000636934 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.48■■□□□ 1.83
CLN8-211ENST00000636934 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.47■■□□□ 1.83
CLN8-211ENST00000636934 KIF14Q15058 1648 aa26.47■■□□□ 1.83
CLN8-211ENST00000636934 CHD1O14646 1710 aa26.46■■□□□ 1.83
CLN8-211ENST00000636934 KDM6BO15054 1643 aa26.45■■□□□ 1.82
CLN8-211ENST00000636934 ATP10BO94823 1461 aa26.44■■□□□ 1.82
CLN8-211ENST00000636934 PTPRGP23470 1445 aa26.43■■□□□ 1.82
CLN8-211ENST00000636934 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.43■■□□□ 1.82
CLN8-211ENST00000636934 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CLN8-211ENST00000636934 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CLN8-211ENST00000636934 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.4■■□□□ 1.82
CLN8-211ENST00000636934 SHROOM2Q13796 1616 aa26.39■■□□□ 1.81
CLN8-211ENST00000636934 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.38■■□□□ 1.81
CLN8-211ENST00000636934 ADGRL2O95490 1459 aa26.38■■□□□ 1.81
CLN8-211ENST00000636934 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CLN8-211ENST00000636934 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.37■■□□□ 1.81
CLN8-211ENST00000636934 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.34■■□□□ 1.81
CLN8-211ENST00000636934 NCOA1Q15788 1441 aa26.32■■□□□ 1.8
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.31■■□□□ 1.8
CLN8-211ENST00000636934 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.31■■□□□ 1.8
CLN8-211ENST00000636934 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.3■■□□□ 1.8
CLN8-211ENST00000636934 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CLN8-211ENST00000636934 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.28■■□□□ 1.8
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.24■■□□□ 1.79
CLN8-211ENST00000636934 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CLN8-211ENST00000636934 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.22■■□□□ 1.79
CLN8-211ENST00000636934 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CLN8-211ENST00000636934 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CLN8-211ENST00000636934 ABCC2Q92887 1545 aa26.18■■□□□ 1.78
CLN8-211ENST00000636934 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.18■■□□□ 1.78
CLN8-211ENST00000636934 PREX2Q70Z35 1606 aa26.18■■□□□ 1.78
CLN8-211ENST00000636934 PZPP20742 1482 aa26.18■■□□□ 1.78
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.16■■□□□ 1.78
CLN8-211ENST00000636934 TSPY4P0CV99 314 aa26.16■■□□□ 1.78
CLN8-211ENST00000636934 TSPY10P0CW01 314 aa26.16■■□□□ 1.78
CLN8-211ENST00000636934 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.15■■□□□ 1.78
CLN8-211ENST00000636934 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.14■■□□□ 1.78
CLN8-211ENST00000636934 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.12■■□□□ 1.77
CLN8-211ENST00000636934 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.12■■□□□ 1.77
CLN8-211ENST00000636934 FOXD1Q16676 465 aa26.11■■□□□ 1.77
CLN8-211ENST00000636934 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.11■■□□□ 1.77
CLN8-211ENST00000636934 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN8-211ENST00000636934 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CLN8-211ENST00000636934 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.08■■□□□ 1.77
CLN8-211ENST00000636934 MBD5Q9P267 1494 aa26.08■■□□□ 1.77
CLN8-211ENST00000636934 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.08■■□□□ 1.77
CLN8-211ENST00000636934 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.07■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.07■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.07■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 ANP32CO43423 234 aa26.07■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 CCER2I3L3R5 266 aa26.05■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.05■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 KIF15Q9NS87 1388 aa26.04■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.765e-6■□□□□ 9.5
CLN8-211ENST00000636934 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.766e-8■□□□□ 11
CLN8-211ENST00000636934 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN8-211ENST00000636934 NUP155O75694 1391 aa26■■□□□ 1.75
CLN8-211ENST00000636934 PKD2Q13563 968 aa26■■□□□ 1.75
CLN8-211ENST00000636934 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CLN8-211ENST00000636934 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.95■■□□□ 1.74
CLN8-211ENST00000636934 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.9■■□□□ 1.74
CLN8-211ENST00000636934 PLXNC1O60486 1568 aa25.9■■□□□ 1.74
CLN8-211ENST00000636934 PLCH2O75038 1416 aa25.89■■□□□ 1.73
CLN8-211ENST00000636934 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.89■■□□□ 1.73
CLN8-211ENST00000636934 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.87■■□□□ 1.73
CLN8-211ENST00000636934 KCNH8Q96L42 1107 aa25.86■■□□□ 1.73
CLN8-211ENST00000636934 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.85■■□□□ 1.73
CLN8-211ENST00000636934 UNC13BO14795 1591 aa25.84■■□□□ 1.73
CLN8-211ENST00000636934 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.83■■□□□ 1.73
CLN8-211ENST00000636934 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.83■■□□□ 1.73
CLN8-211ENST00000636934 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.83■■□□□ 1.73
CLN8-211ENST00000636934 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CLN8-211ENST00000636934 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.82■■□□□ 1.72
CLN8-211ENST00000636934 CCDC7Q96M83 1385 aa25.82■■□□□ 1.72
CLN8-211ENST00000636934 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.82■■□□□ 1.72
CLN8-211ENST00000636934 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.81■■□□□ 1.72
CLN8-211ENST00000636934 ABCC1P33527 1531 aa25.78■■□□□ 1.72
CLN8-211ENST00000636934 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CLN8-211ENST00000636934 ERBINQ96RT1 1412 aa25.77■■□□□ 1.72
CLN8-211ENST00000636934 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.75■■□□□ 1.71
CLN8-211ENST00000636934 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.74■■□□□ 1.71
CLN8-211ENST00000636934 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.72■■□□□ 1.71
CLN8-211ENST00000636934 USP47Q96K76 1375 aa25.7■■□□□ 1.71
CLN8-211ENST00000636934 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.7■■□□□ 1.7
CLN8-211ENST00000636934 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CLN8-211ENST00000636934 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.68■■□□□ 1.7
CLN8-211ENST00000636934 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.68■■□□□ 1.7
CLN8-211ENST00000636934 KDM5CP41229 1560 aa25.68■■□□□ 1.7
CLN8-211ENST00000636934 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CLN8-211ENST00000636934 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CLN8-211ENST00000636934 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.67■■□□□ 1.7
CLN8-211ENST00000636934 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.64■■□□□ 1.69
CLN8-211ENST00000636934 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.63■■□□□ 1.69
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