RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631166.1

HS1BP3-208, Transcript of HCLS1 binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene HS1BP3, Length 78 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HS1BP3-208	ENST00000631166	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	RGS12	O14924	1447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	NUP160	Q12769	1436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	CD109	Q6YHK3	1445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	ALK	Q9UM73	1620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	APLP1	P51693	650 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	WDR97	A6NE52	1622 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	FANCA	O15360	1455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	RGS19	P49795	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	USP19	O94966	1318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	PTPRG	P23470	1445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	AFF2	P51816	1311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	KCNH8	Q96L42	1107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HS1BP3-208	ENST00000631166	EP400	Q96L91	3159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	UTRN	P46939	3433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	LRP6	O75581	1613 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	SNX27	Q96L92	541 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	BAG6	P46379	1132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	CHD4	Q14839	1912 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HS1BP3-208	ENST00000631166	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	KCNQ2	O43526	872 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	CUL7	Q14999	1698 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	PCNT	O95613	3336 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	GPR162	Q16538	588 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	PBRM1	Q86U86	1689 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HS1BP3-208	ENST00000631166	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms