RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 HECW1Q76N89 1606 aa29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC3-209ENST00000616395 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATP10AO60312 1499 aa29.64■■■□□ 2.33
TRAPPC3-209ENST00000616395 STRCQ7RTU9 1775 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3-209ENST00000616395 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLCH2O75038 1416 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3-209ENST00000616395 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3-209ENST00000616395 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTPRTO14522 1441 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3-209ENST00000616395 AFAP1Q8N556 730 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3-209ENST00000616395 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3-209ENST00000616395 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 KDM5CP41229 1560 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 C3P01024 1663 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 EEA1Q15075 1411 aa29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIF14Q15058 1648 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 REREQ9P2R6 1566 aa29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 NCOA1Q15788 1441 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 ABCA6Q8N139 1617 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 AGLP35573 1532 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 FMN1Q68DA7 1419 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLIP1P30622 1438 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 ABCC1P33527 1531 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 NPATQ14207 1427 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 PREX2Q70Z35 1606 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZMYM3Q14202 1370 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 MROH2AA6NES4 1674 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 PKD2Q13563 968 aa29■■■□□ 2.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLA2R1Q13018 1463 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSPA1LP34931 641 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTPRKQ15262 1439 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 PIP4K2BP78356 416 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLXNC1O60486 1568 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 GGT6Q6P531 493 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATP7AQ04656 1500 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 A2MP01023 1474 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC3-209ENST00000616395 TOM1O60784 492 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3-209ENST00000616395 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3-209ENST00000616395 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3-209ENST00000616395 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC3-209ENST00000616395 CPS1P31327 1500 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3-209ENST00000616395 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3-209ENST00000616395 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3-209ENST00000616395 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms