RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613308.4

RDM1-216, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene RDM1, Length 779 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-216ENST00000613308 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.66■□□□□ 0.9
RDM1-216ENST00000613308 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
RDM1-216ENST00000613308 DSG3P32926 999 aa20.65■□□□□ 0.9
RDM1-216ENST00000613308 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 AKNAQ7Z591 1439 aa20.61■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 MLECQ14165 292 aa20.61■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.6■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 FANCAO15360 1455 aa20.6■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.59■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.59■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.58■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.57■□□□□ 0.88
RDM1-216ENST00000613308 SOCS7O14512 581 aa20.53■□□□□ 0.88
RDM1-216ENST00000613308 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RDM1-216ENST00000613308 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.52■□□□□ 0.88
RDM1-216ENST00000613308 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.51■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.51■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.5■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 ILDR2Q71H61 639 aa20.5■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 SAMD9Q5K651 1589 aa20.5■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.5■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.49■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 RICTORQ6R327 1708 aa20.48■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.46■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.44■□□□□ 0.86
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RDM1-216ENST00000613308 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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RDM1-216ENST00000613308 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.41■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.4■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 ATP10AO60312 1499 aa20.4■□□□□ 0.86
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RDM1-216ENST00000613308 PLCH2O75038 1416 aa20.37■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.37■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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RDM1-216ENST00000613308 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.34■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.34■□□□□ 0.85
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RDM1-216ENST00000613308 AFAP1Q8N556 730 aa20.27■□□□□ 0.84
RDM1-216ENST00000613308 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
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RDM1-216ENST00000613308 PLA2R1Q13018 1463 aa19.92■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 PREX2Q70Z35 1606 aa19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 HSPA1LP34931 641 aa19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 MROH2AA6NES4 1674 aa19.91■□□□□ 0.78
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RDM1-216ENST00000613308 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.9■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
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