RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.53■□□□□ 0.88
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PDE4C-211ENST00000597360 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PDE4C-211ENST00000597360 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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PDE4C-211ENST00000597360 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
PDE4C-211ENST00000597360 HFM1A2PYH4 1435 aa19.92■□□□□ 0.78
PDE4C-211ENST00000597360 PANK2Q9BZ23 570 aa19.92■□□□□ 0.78
PDE4C-211ENST00000597360 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PDE4C-211ENST00000597360 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
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