RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.42■■□□□ 1.18
CTIF-211ENST00000592658 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.39■■□□□ 1.17
CTIF-211ENST00000592658 ATP10AO60312 1499 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-211ENST00000592658 PLCH2O75038 1416 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-211ENST00000592658 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-211ENST00000592658 SOCS7O14512 581 aa22.37■■□□□ 1.17
CTIF-211ENST00000592658 STRCQ7RTU9 1775 aa22.37■■□□□ 1.17
CTIF-211ENST00000592658 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.36■■□□□ 1.17
CTIF-211ENST00000592658 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTIF-211ENST00000592658 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTIF-211ENST00000592658 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTIF-211ENST00000592658 EEA1Q15075 1411 aa22.31■■□□□ 1.16
CTIF-211ENST00000592658 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.31■■□□□ 1.16
CTIF-211ENST00000592658 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-211ENST00000592658 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-211ENST00000592658 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-211ENST00000592658 KDM5CP41229 1560 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-211ENST00000592658 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-211ENST00000592658 PTPRTO14522 1441 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-211ENST00000592658 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-211ENST00000592658 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTIF-211ENST00000592658 REREQ9P2R6 1566 aa22.2■■□□□ 1.14
CTIF-211ENST00000592658 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.2■■□□□ 1.14
CTIF-211ENST00000592658 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.2■■□□□ 1.14
CTIF-211ENST00000592658 C3P01024 1663 aa22.18■■□□□ 1.14
CTIF-211ENST00000592658 KIF14Q15058 1648 aa22.18■■□□□ 1.14
CTIF-211ENST00000592658 AFAP1Q8N556 730 aa22.18■■□□□ 1.14
CTIF-211ENST00000592658 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.15■■□□□ 1.14
CTIF-211ENST00000592658 ABCA6Q8N139 1617 aa22.14■■□□□ 1.14
CTIF-211ENST00000592658 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-211ENST00000592658 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-211ENST00000592658 AGLP35573 1532 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-211ENST00000592658 FMN1Q68DA7 1419 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-211ENST00000592658 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTIF-211ENST00000592658 NCOA1Q15788 1441 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-211ENST00000592658 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-211ENST00000592658 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTIF-211ENST00000592658 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.06■■□□□ 1.12
CTIF-211ENST00000592658 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTIF-211ENST00000592658 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.06■■□□□ 1.12
CTIF-211ENST00000592658 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-211ENST00000592658 ABCC1P33527 1531 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-211ENST00000592658 CLIP1P30622 1438 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-211ENST00000592658 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.03■■□□□ 1.12
CTIF-211ENST00000592658 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.03■■□□□ 1.12
CTIF-211ENST00000592658 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTIF-211ENST00000592658 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-211ENST00000592658 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-211ENST00000592658 PREX2Q70Z35 1606 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-211ENST00000592658 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-211ENST00000592658 NPATQ14207 1427 aa22■■□□□ 1.11
CTIF-211ENST00000592658 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22■■□□□ 1.11
CTIF-211ENST00000592658 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTIF-211ENST00000592658 MROH2AA6NES4 1674 aa21.98■■□□□ 1.11
CTIF-211ENST00000592658 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CTIF-211ENST00000592658 ZMYM3Q14202 1370 aa21.92■■□□□ 1.1
CTIF-211ENST00000592658 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.92■■□□□ 1.1
CTIF-211ENST00000592658 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.91■■□□□ 1.1
CTIF-211ENST00000592658 PLA2R1Q13018 1463 aa21.9■■□□□ 1.1
CTIF-211ENST00000592658 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.9■■□□□ 1.1
CTIF-211ENST00000592658 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CTIF-211ENST00000592658 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.89■■□□□ 1.1
CTIF-211ENST00000592658 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.88■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.86■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 PKD2Q13563 968 aa21.86■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 PLXNC1O60486 1568 aa21.84■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 PTPRKQ15262 1439 aa21.83■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.83■■□□□ 1.09
CTIF-211ENST00000592658 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.82■■□□□ 1.08
CTIF-211ENST00000592658 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CTIF-211ENST00000592658 ATP7AQ04656 1500 aa21.79■■□□□ 1.08
CTIF-211ENST00000592658 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CTIF-211ENST00000592658 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CTIF-211ENST00000592658 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
CTIF-211ENST00000592658 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CTIF-211ENST00000592658 A2MP01023 1474 aa21.77■■□□□ 1.07
CTIF-211ENST00000592658 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.76■■□□□ 1.07
CTIF-211ENST00000592658 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CTIF-211ENST00000592658 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.76■■□□□ 1.07
CTIF-211ENST00000592658 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.75■■□□□ 1.07
CTIF-211ENST00000592658 HSPA1LP34931 641 aa21.74■■□□□ 1.07
CTIF-211ENST00000592658 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CTIF-211ENST00000592658 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.72■■□□□ 1.07
CTIF-211ENST00000592658 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.71■■□□□ 1.07
CTIF-211ENST00000592658 GGT6Q6P531 493 aa21.7■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.7■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 CPS1P31327 1500 aa21.69■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.69■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.67■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 PIP4K2BP78356 416 aa21.66■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.65■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 TOM1O60784 492 aa21.65■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CTIF-211ENST00000592658 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CTIF-211ENST00000592658 ALKQ9UM73 1620 aa21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms