RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.1■■□□□ 1.77
POLR2E-210ENST00000592597 HECW1Q76N89 1606 aa26.1■■□□□ 1.77
POLR2E-210ENST00000592597 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
POLR2E-210ENST00000592597 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.08■■□□□ 1.77
POLR2E-210ENST00000592597 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.02■■□□□ 1.76
POLR2E-210ENST00000592597 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.01■■□□□ 1.75
POLR2E-210ENST00000592597 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.01■■□□□ 1.75
POLR2E-210ENST00000592597 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2E-210ENST00000592597 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
POLR2E-210ENST00000592597 ATP10AO60312 1499 aa25.96■■□□□ 1.75
POLR2E-210ENST00000592597 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.93■■□□□ 1.74
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.91■■□□□ 1.74
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POLR2E-210ENST00000592597 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.87■■□□□ 1.73
POLR2E-210ENST00000592597 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.87■■□□□ 1.73
POLR2E-210ENST00000592597 PLCH2O75038 1416 aa25.87■■□□□ 1.73
POLR2E-210ENST00000592597 PTPRTO14522 1441 aa25.85■■□□□ 1.73
POLR2E-210ENST00000592597 C3P01024 1663 aa25.83■■□□□ 1.73
POLR2E-210ENST00000592597 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.82■■□□□ 1.72
POLR2E-210ENST00000592597 AFAP1Q8N556 730 aa25.8■■□□□ 1.72
POLR2E-210ENST00000592597 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.8■■□□□ 1.72
POLR2E-210ENST00000592597 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.79■■□□□ 1.72
POLR2E-210ENST00000592597 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
POLR2E-210ENST00000592597 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.73■■□□□ 1.71
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POLR2E-210ENST00000592597 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.71■■□□□ 1.71
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.71■■□□□ 1.71
POLR2E-210ENST00000592597 KIF14Q15058 1648 aa25.7■■□□□ 1.71
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POLR2E-210ENST00000592597 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.68■■□□□ 1.7
POLR2E-210ENST00000592597 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.67■■□□□ 1.7
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POLR2E-210ENST00000592597 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.65■■□□□ 1.7
POLR2E-210ENST00000592597 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.65■■□□□ 1.7
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POLR2E-210ENST00000592597 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.59■■□□□ 1.69
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POLR2E-210ENST00000592597 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.56■■□□□ 1.68
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POLR2E-210ENST00000592597 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
POLR2E-210ENST00000592597 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
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POLR2E-210ENST00000592597 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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POLR2E-210ENST00000592597 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.48■■□□□ 1.67
POLR2E-210ENST00000592597 ZMYM3Q14202 1370 aa25.48■■□□□ 1.67
POLR2E-210ENST00000592597 PIP4K2BP78356 416 aa25.48■■□□□ 1.67
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POLR2E-210ENST00000592597 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.4■■□□□ 1.66
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POLR2E-210ENST00000592597 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
POLR2E-210ENST00000592597 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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POLR2E-210ENST00000592597 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.36■■□□□ 1.65
POLR2E-210ENST00000592597 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.34■■□□□ 1.65
POLR2E-210ENST00000592597 PTPRKQ15262 1439 aa25.33■■□□□ 1.65
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POLR2E-210ENST00000592597 GGT6Q6P531 493 aa25.31■■□□□ 1.64
POLR2E-210ENST00000592597 TOM1O60784 492 aa25.3■■□□□ 1.64
POLR2E-210ENST00000592597 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
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POLR2E-210ENST00000592597 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.27■■□□□ 1.64
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POLR2E-210ENST00000592597 ATP7AQ04656 1500 aa25.22■■□□□ 1.63
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POLR2E-210ENST00000592597 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
POLR2E-210ENST00000592597 A2MP01023 1474 aa25.21■■□□□ 1.63
POLR2E-210ENST00000592597 PLXNC1O60486 1568 aa25.2■■□□□ 1.62
POLR2E-210ENST00000592597 CPS1P31327 1500 aa25.2■■□□□ 1.62
POLR2E-210ENST00000592597 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.19■■□□□ 1.62
POLR2E-210ENST00000592597 ALKQ9UM73 1620 aa25.18■■□□□ 1.62
POLR2E-210ENST00000592597 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
POLR2E-210ENST00000592597 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
POLR2E-210ENST00000592597 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
POLR2E-210ENST00000592597 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.14■■□□□ 1.61
POLR2E-210ENST00000592597 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2E-210ENST00000592597 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2E-210ENST00000592597 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.611e-6■■□□□ 13.7
POLR2E-210ENST00000592597 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.08■■□□□ 1.61
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