RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.38□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 ITGAEP38570 1179 aa8.38□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.37□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 AKNAQ7Z591 1439 aa8.36□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.36□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.35□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 ABCB7O75027 752 aa8.35□□□□□ -1.07
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SEH1L-210ENST00000592582 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.35□□□□□ -1.07
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SEH1L-210ENST00000592582 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.34□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 POLA2Q14181 598 aa8.33□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 P3H3Q8IVL6 736 aa8.33□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.33□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 IQGAP2Q13576 1575 aa8.33□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 FMN1Q68DA7 1419 aa8.32□□□□□ -1.08
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SEH1L-210ENST00000592582 SHROOM2Q13796 1616 aa8.32□□□□□ -1.08
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SEH1L-210ENST00000592582 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.31□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 KIAA0556O60303 1618 aa8.31□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 NESP48681 1621 aa8.31□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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SEH1L-210ENST00000592582 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.29□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.29□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.29□□□□□ -1.08
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SEH1L-210ENST00000592582 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.28□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.28□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.28□□□□□ -1.08
SEH1L-210ENST00000592582 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.28□□□□□ -1.08
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SEH1L-210ENST00000592582 SPOCK2Q92563 424 aa8.26□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.25□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 E9PCH4 1651 aa8.25□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.25□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.25□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.24□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.24□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 DISP1Q96F81 1524 aa8.23□□□□□ -1.09
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SEH1L-210ENST00000592582 PLEKHG5O94827 1062 aa8.23□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 KDM6BO15054 1643 aa8.22□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 HFM1A2PYH4 1435 aa8.22□□□□□ -1.09
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SEH1L-210ENST00000592582 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.21□□□□□ -1.09
SEH1L-210ENST00000592582 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.21□□□□□ -1.1
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SEH1L-210ENST00000592582 MBD5Q9P267 1494 aa8.2□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.2□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 ADGRL2O95490 1459 aa8.2□□□□□ -1.1
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SEH1L-210ENST00000592582 TONSLQ96HA7 1378 aa8.19□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.19□□□□□ -1.1
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SEH1L-210ENST00000592582 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.18□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 NCOA2Q15596 1464 aa8.17□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 PTPRKQ15262 1439 aa8.17□□□□□ -1.1
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SEH1L-210ENST00000592582 NUP160Q12769 1436 aa8.16□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 C14orf37Q86TY3 774 aa8.16□□□□□ -1.1
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SEH1L-210ENST00000592582 UNC13BO14795 1591 aa8.16□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 PREX2Q70Z35 1606 aa8.15□□□□□ -1.1
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SEH1L-210ENST00000592582 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.15□□□□□ -1.1
SEH1L-210ENST00000592582 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.15□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.15□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.15□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 ANP32CO43423 234 aa8.14□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.14□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 KIF14Q15058 1648 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 NAIPQ13075 1403 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 PLXNC1O60486 1568 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 UACAQ9BZF9 1416 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 ROCK1Q13464 1354 aa8.12□□□□□ -1.11
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