RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 DMRT2Q9Y5R5 561 aa38.51■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.51■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.45■■■■□ 3.756e-24■■□□□ 13
CAPNS1-214ENST00000592483 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.43■■■■□ 3.74
CAPNS1-214ENST00000592483 HECW1Q76N89 1606 aa38.41■■■■□ 3.74
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.39■■■■□ 3.74
CAPNS1-214ENST00000592483 STRCQ7RTU9 1775 aa38.35■■■■□ 3.73
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.35■■■■□ 3.73
CAPNS1-214ENST00000592483 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP10AO60312 1499 aa38.34■■■■□ 3.73
CAPNS1-214ENST00000592483 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.32■■■■□ 3.73
CAPNS1-214ENST00000592483 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.28■■■■□ 3.72
CAPNS1-214ENST00000592483 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.25■■■■□ 3.71
CAPNS1-214ENST00000592483 PLCH2O75038 1416 aa38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-214ENST00000592483 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRTO14522 1441 aa38.21■■■■□ 3.71
CAPNS1-214ENST00000592483 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-214ENST00000592483 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-214ENST00000592483 IQSEC2Q5JU85 1478 aa38.09■■■■□ 3.69
CAPNS1-214ENST00000592483 LTBP4Q8N2S1 1624 aa38.08■■■■□ 3.69
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.03■■■■□ 3.68
CAPNS1-214ENST00000592483 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.02■■■■□ 3.68
CAPNS1-214ENST00000592483 AFAP1Q8N556 730 aa37.98■■■■□ 3.67
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.98■■■■□ 3.67
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM5CP41229 1560 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-214ENST00000592483 C3P01024 1663 aa37.95■■■■□ 3.66
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.94■■■■□ 3.66
CAPNS1-214ENST00000592483 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.93■■■■□ 3.66
CAPNS1-214ENST00000592483 REREQ9P2R6 1566 aa37.93■■■■□ 3.66
CAPNS1-214ENST00000592483 NCOA1Q15788 1441 aa37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-214ENST00000592483 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-214ENST00000592483 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
CAPNS1-214ENST00000592483 AGLP35573 1532 aa37.82■■■■□ 3.65
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.82■■■■□ 3.65
CAPNS1-214ENST00000592483 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.82■■■■□ 3.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF14Q15058 1648 aa37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCA6Q8N139 1617 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-214ENST00000592483 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.73■■■■□ 3.63
CAPNS1-214ENST00000592483 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FMN1Q68DA7 1419 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP162Q5TB80 1403 aa37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-214ENST00000592483 NPATQ14207 1427 aa37.7■■■■□ 3.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CLIP1P30622 1438 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.63■■■■□ 3.61
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.61■■■■□ 3.61
CAPNS1-214ENST00000592483 PKD2Q13563 968 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMYM3Q14202 1370 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-214ENST00000592483 MROH2AA6NES4 1674 aa37.57■■■■□ 3.61
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC1P33527 1531 aa37.56■■■■□ 3.6
CAPNS1-214ENST00000592483 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2R1Q13018 1463 aa37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.51■■■■□ 3.6
CAPNS1-214ENST00000592483 PREX2Q70Z35 1606 aa37.49■■■■□ 3.59
CAPNS1-214ENST00000592483 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-214ENST00000592483 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPA1LP34931 641 aa37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRKQ15262 1439 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TOM1O60784 492 aa37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-214ENST00000592483 PIP4K2BP78356 416 aa37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.29■■■■□ 3.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.24■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.24■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CPS1P31327 1500 aa37.24■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 GGT6Q6P531 493 aa37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PLXNC1O60486 1568 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 A2MP01023 1474 aa37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.2■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.2■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP7AQ04656 1500 aa37.2■■■■□ 3.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-214ENST00000592483 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-214ENST00000592483 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-214ENST00000592483 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.13■■■■□ 3.53
CAPNS1-214ENST00000592483 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-214ENST00000592483 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-214ENST00000592483 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.08■■■■□ 3.53
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