RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591152.5

PSME3-211, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene PSME3, Length 1,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-211ENST00000591152 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.21■■■■□ 3.23
PSME3-211ENST00000591152 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
PSME3-211ENST00000591152 ILDR2Q71H61 639 aa35.19■■■■□ 3.22
PSME3-211ENST00000591152 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
PSME3-211ENST00000591152 ATP10AO60312 1499 aa35.12■■■■□ 3.21
PSME3-211ENST00000591152 PLCH2O75038 1416 aa35.11■■■■□ 3.21
PSME3-211ENST00000591152 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.11■■■■□ 3.21
PSME3-211ENST00000591152 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.08■■■■□ 3.21
PSME3-211ENST00000591152 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.07■■■■□ 3.21
PSME3-211ENST00000591152 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
PSME3-211ENST00000591152 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.06■■■■□ 3.2
PSME3-211ENST00000591152 SOCS7O14512 581 aa35.05■■■■□ 3.2
PSME3-211ENST00000591152 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.03■■■■□ 3.2
PSME3-211ENST00000591152 STRCQ7RTU9 1775 aa35■■■■□ 3.19
PSME3-211ENST00000591152 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.99■■■■□ 3.19
PSME3-211ENST00000591152 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.97■■■■□ 3.19
PSME3-211ENST00000591152 EEA1Q15075 1411 aa34.96■■■■□ 3.19
PSME3-211ENST00000591152 AFAP1Q8N556 730 aa34.95■■■■□ 3.19
PSME3-211ENST00000591152 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.91■■■■□ 3.18
PSME3-211ENST00000591152 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.89■■■■□ 3.18
PSME3-211ENST00000591152 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.88■■■■□ 3.17
PSME3-211ENST00000591152 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
PSME3-211ENST00000591152 KIF14Q15058 1648 aa34.84■■■■□ 3.17
PSME3-211ENST00000591152 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.83■■■■□ 3.17
PSME3-211ENST00000591152 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.83■■■■□ 3.17
PSME3-211ENST00000591152 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
PSME3-211ENST00000591152 PTPRTO14522 1441 aa34.81■■■■□ 3.16
PSME3-211ENST00000591152 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
PSME3-211ENST00000591152 KDM5CP41229 1560 aa34.79■■■■□ 3.16
PSME3-211ENST00000591152 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.79■■■■□ 3.16
PSME3-211ENST00000591152 FMN1Q68DA7 1419 aa34.76■■■■□ 3.16
PSME3-211ENST00000591152 C3P01024 1663 aa34.76■■■■□ 3.15
PSME3-211ENST00000591152 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
PSME3-211ENST00000591152 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
PSME3-211ENST00000591152 ABCA6Q8N139 1617 aa34.7■■■■□ 3.15
PSME3-211ENST00000591152 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.7■■■■□ 3.15
PSME3-211ENST00000591152 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.69■■■■□ 3.14
PSME3-211ENST00000591152 CLIP1P30622 1438 aa34.68■■■■□ 3.14
PSME3-211ENST00000591152 REREQ9P2R6 1566 aa34.68■■■■□ 3.14
PSME3-211ENST00000591152 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.66■■■■□ 3.14
PSME3-211ENST00000591152 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.66■■■■□ 3.14
PSME3-211ENST00000591152 NCOA1Q15788 1441 aa34.63■■■■□ 3.13
PSME3-211ENST00000591152 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.61■■■■□ 3.13
PSME3-211ENST00000591152 AGLP35573 1532 aa34.61■■■■□ 3.13
PSME3-211ENST00000591152 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.58■■■■□ 3.13
PSME3-211ENST00000591152 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.55■■■■□ 3.12
PSME3-211ENST00000591152 ABCC1P33527 1531 aa34.55■■■■□ 3.12
PSME3-211ENST00000591152 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.55■■■■□ 3.12
PSME3-211ENST00000591152 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.54■■■■□ 3.12
PSME3-211ENST00000591152 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.53■■■■□ 3.12
PSME3-211ENST00000591152 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.52■■■■□ 3.12
PSME3-211ENST00000591152 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
PSME3-211ENST00000591152 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.5■■■■□ 3.11
PSME3-211ENST00000591152 PREX2Q70Z35 1606 aa34.5■■■■□ 3.11
PSME3-211ENST00000591152 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.49■■■■□ 3.11
PSME3-211ENST00000591152 ZMYM3Q14202 1370 aa34.47■■■■□ 3.11
PSME3-211ENST00000591152 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
PSME3-211ENST00000591152 NPATQ14207 1427 aa34.44■■■■□ 3.1
PSME3-211ENST00000591152 MROH2AA6NES4 1674 aa34.37■■■■□ 3.09
PSME3-211ENST00000591152 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.36■■■■□ 3.09
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PSME3-211ENST00000591152 PKD2Q13563 968 aa34.33■■■■□ 3.09
PSME3-211ENST00000591152 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.33■■■■□ 3.09
PSME3-211ENST00000591152 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
PSME3-211ENST00000591152 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.3■■■■□ 3.08
PSME3-211ENST00000591152 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.3■■■■□ 3.08
PSME3-211ENST00000591152 GGT6Q6P531 493 aa34.29■■■■□ 3.08
PSME3-211ENST00000591152 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.27■■■■□ 3.08
PSME3-211ENST00000591152 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
PSME3-211ENST00000591152 PLA2R1Q13018 1463 aa34.26■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 PTPRKQ15262 1439 aa34.25■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.25■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 ATP7AQ04656 1500 aa34.21■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 PIP4K2BP78356 416 aa34.21■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 A2MP01023 1474 aa34.2■■■■□ 3.07
PSME3-211ENST00000591152 HSPA1LP34931 641 aa34.19■■■■□ 3.06
PSME3-211ENST00000591152 PLXNC1O60486 1568 aa34.16■■■■□ 3.06
PSME3-211ENST00000591152 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
PSME3-211ENST00000591152 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
PSME3-211ENST00000591152 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.11■■■■□ 3.05
PSME3-211ENST00000591152 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.08■■■■□ 3.05
PSME3-211ENST00000591152 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
PSME3-211ENST00000591152 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.07■■■■□ 3.05
PSME3-211ENST00000591152 TOM1O60784 492 aa34.07■■■■□ 3.04
PSME3-211ENST00000591152 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.07■■■■□ 3.04
PSME3-211ENST00000591152 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.06■■■■□ 3.04
PSME3-211ENST00000591152 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
PSME3-211ENST00000591152 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.01■■■■□ 3.03
PSME3-211ENST00000591152 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
PSME3-211ENST00000591152 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
PSME3-211ENST00000591152 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.98■■■■□ 3.03
PSME3-211ENST00000591152 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.98■■■■□ 3.03
PSME3-211ENST00000591152 CPS1P31327 1500 aa33.98■■■■□ 3.03
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