RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580206.1

ANKRD30B-204, Transcript of ankyrin repeat domain 30B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKRD30B, Length 3,429 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD30B-204ENST00000580206 PTPRGP23470 1445 aa18.48■□□□□ 0.55
ANKRD30B-204ENST00000580206 HFM1A2PYH4 1435 aa18.46■□□□□ 0.55
ANKRD30B-204ENST00000580206 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 CCDC184Q52MB2 194 aa18.43■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.43■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 GRIN2AQ12879 1464 aa18.41■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 TMC1Q8TDI8 760 aa18.41■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 MAP3K1Q13233 1512 aa18.41■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.4■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.4■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.4■□□□□ 0.54
ANKRD30B-204ENST00000580206 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.39■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.38■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.37■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.36■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.36■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.35■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 DAPK1P53355 1430 aa18.33■□□□□ 0.53
ANKRD30B-204ENST00000580206 HECW1Q76N89 1606 aa18.33■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 AFAP1Q8N556 730 aa18.33■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 ABCC5O15440 1437 aa18.32■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 ARHGEF11O15085 1522 aa18.32■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.29■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 CCER2I3L3R5 266 aa18.29■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.29■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 KIF15Q9NS87 1388 aa18.28■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 GGT6Q6P531 493 aa18.28■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 ADAMTS12P58397 1594 aa18.28■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.28■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 SYNJ2O15056 1496 aa18.27■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
ANKRD30B-204ENST00000580206 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 KIF3BO15066 747 aa18.26■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.25■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.25■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 DISP1Q96F81 1524 aa18.25■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.24■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 MIA2Q96PC5 1412 aa18.24■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.24■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.24■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 PBRM1Q86U86 1689 aa18.22■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 USP47Q96K76 1375 aa18.22■□□□□ 0.51
ANKRD30B-204ENST00000580206 SAMD9Q5K651 1589 aa18.2■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.2■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 CCDC7Q96M83 1385 aa18.19■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.18■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 KDM6BO15054 1643 aa18.18■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.18■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 WDR62O43379 1518 aa18.18■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 NCOA1Q15788 1441 aa18.17■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 KIAA0556O60303 1618 aa18.15■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 ATP10BO94823 1461 aa18.15■□□□□ 0.5
ANKRD30B-204ENST00000580206 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD30B-204ENST00000580206 MLECQ14165 292 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD30B-204ENST00000580206 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD30B-204ENST00000580206 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD30B-204ENST00000580206 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD30B-204ENST00000580206 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.11■□□□□ 0.49
ANKRD30B-204ENST00000580206 CEP170Q5SW79 1584 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD30B-204ENST00000580206 AKNAQ7Z591 1439 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD30B-204ENST00000580206 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 NEUROD2Q15784 382 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 KIF14Q15058 1648 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 PANK3Q9H999 370 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 BCL11AQ9H165 835 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 ROCK1Q13464 1354 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.04■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.04■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 STK26Q9P289 416 aa18.04■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 TMF1P82094 1093 aa18.03■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.03■□□□□ 0.48
ANKRD30B-204ENST00000580206 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
ANKRD30B-204ENST00000580206 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ANKRD30B-204ENST00000580206 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.01■□□□□ 0.47
ANKRD30B-204ENST00000580206 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ANKRD30B-204ENST00000580206 OSCARQ8IYS5 282 aa18■□□□□ 0.47
ANKRD30B-204ENST00000580206 RAPGEF3O95398 923 aa17.98■□□□□ 0.47
ANKRD30B-204ENST00000580206 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.98■□□□□ 0.47
ANKRD30B-204ENST00000580206 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.98■□□□□ 0.47
ANKRD30B-204ENST00000580206 NUP160Q12769 1436 aa17.97■□□□□ 0.47
ANKRD30B-204ENST00000580206 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.96■□□□□ 0.47
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