RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575454.1

SMG6-218, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 652 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-218ENST00000575454 SOCS7O14512 581 aa14.99□□□□□ -0.01
SMG6-218ENST00000575454 ATP10AO60312 1499 aa14.98□□□□□ -0.01
SMG6-218ENST00000575454 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SMG6-218ENST00000575454 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.98□□□□□ -0.01
SMG6-218ENST00000575454 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.96□□□□□ -0.01
SMG6-218ENST00000575454 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 FMN1Q68DA7 1419 aa14.94□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.94□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 RICTORQ6R327 1708 aa14.93□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 HECW1Q76N89 1606 aa14.92□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.92□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.92□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 AFAP1Q8N556 730 aa14.91□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.9□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.9□□□□□ -0.02
SMG6-218ENST00000575454 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.89□□□□□ -0.03
SMG6-218ENST00000575454 CLIP1P30622 1438 aa14.88□□□□□ -0.03
SMG6-218ENST00000575454 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SMG6-218ENST00000575454 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.86□□□□□ -0.03
SMG6-218ENST00000575454 PTPRTO14522 1441 aa14.84□□□□□ -0.03
SMG6-218ENST00000575454 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.83□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.82□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.82□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.81□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.8□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.8□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 KDM5CP41229 1560 aa14.79□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.78□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 KIF14Q15058 1648 aa14.77□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 REREQ9P2R6 1566 aa14.77□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 AGLP35573 1532 aa14.77□□□□□ -0.04
SMG6-218ENST00000575454 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.77□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.74□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.73□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 STRCQ7RTU9 1775 aa14.73□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 NPATQ14207 1427 aa14.73□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 NCOA1Q15788 1441 aa14.73□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.72□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.72□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.72□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 ZMYM3Q14202 1370 aa14.72□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 PKD2Q13563 968 aa14.71□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SMG6-218ENST00000575454 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.7□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 ABCC1P33527 1531 aa14.68□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.67□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.67□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.66□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.062e-14■■■■■ 29.9
SMG6-218ENST00000575454 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.66□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.65□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 ABCA6Q8N139 1617 aa14.65□□□□□ -0.06
SMG6-218ENST00000575454 GGT6Q6P531 493 aa14.64□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.63□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 PLA2R1Q13018 1463 aa14.62□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.61□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 PREX2Q70Z35 1606 aa14.61□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 C3P01024 1663 aa14.61□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.6□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.6□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 A2MP01023 1474 aa14.6□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.6□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 PTPRKQ15262 1439 aa14.59□□□□□ -0.07
SMG6-218ENST00000575454 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 TOM1O60784 492 aa14.57□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.57□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.56□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.56□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.56□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.55□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 ATP7AQ04656 1500 aa14.55□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 MROH2AA6NES4 1674 aa14.53□□□□□ -0.08
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SMG6-218ENST00000575454 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.53□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.52□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SMG6-218ENST00000575454 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.52□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 PLXNC1O60486 1568 aa14.51□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.51□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 PIP4K2BP78356 416 aa14.51□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 TNRQ92752 1358 aa14.5□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.5□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 KIF3BO15066 747 aa14.5□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 HSPA1LP34931 641 aa14.5□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 MBD5Q9P267 1494 aa14.47□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SMG6-218ENST00000575454 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
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