RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569050.1

PKM-223, Transcript of pyruvate kinase M1/2, human

TSL 4

Gene PKM, Length 457 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKM-223	ENST00000569050	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PKM-223	ENST00000569050	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PKM-223	ENST00000569050	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PKM-223	ENST00000569050	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PKM-223	ENST00000569050	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PKM-223	ENST00000569050	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PKM-223	ENST00000569050	ATP10A	O60312	1499 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PKM-223	ENST00000569050	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PKM-223	ENST00000569050	PLCH2	O75038	1416 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PKM-223	ENST00000569050	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PKM-223	ENST00000569050	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PKM-223	ENST00000569050	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PKM-223	ENST00000569050	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PKM-223	ENST00000569050	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PKM-223	ENST00000569050	PTPRT	O14522	1441 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PKM-223	ENST00000569050	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PKM-223	ENST00000569050	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PKM-223	ENST00000569050	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PKM-223	ENST00000569050	KDM5C	P41229	1560 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PKM-223	ENST00000569050	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PKM-223	ENST00000569050	EEA1	Q15075	1411 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PKM-223	ENST00000569050	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PKM-223	ENST00000569050	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PKM-223	ENST00000569050	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
PKM-223	ENST00000569050	KIF14	Q15058	1648 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PKM-223	ENST00000569050	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PKM-223	ENST00000569050	C3	P01024	1663 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PKM-223	ENST00000569050	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PKM-223	ENST00000569050	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PKM-223	ENST00000569050	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PKM-223	ENST00000569050	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PKM-223	ENST00000569050	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PKM-223	ENST00000569050	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PKM-223	ENST00000569050	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PKM-223	ENST00000569050	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PKM-223	ENST00000569050	AGL	P35573	1532 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PKM-223	ENST00000569050	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PKM-223	ENST00000569050	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PKM-223	ENST00000569050	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PKM-223	ENST00000569050	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PKM-223	ENST00000569050	CLIP1	P30622	1438 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PKM-223	ENST00000569050	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PKM-223	ENST00000569050	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PKM-223	ENST00000569050	ABCC1	P33527	1531 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PKM-223	ENST00000569050	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PKM-223	ENST00000569050	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PKM-223	ENST00000569050	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PKM-223	ENST00000569050	NPAT	Q14207	1427 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PKM-223	ENST00000569050	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PKM-223	ENST00000569050	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PKM-223	ENST00000569050	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PKM-223	ENST00000569050	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PKM-223	ENST00000569050	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PKM-223	ENST00000569050	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PKM-223	ENST00000569050	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PKM-223	ENST00000569050	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PKM-223	ENST00000569050	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PKM-223	ENST00000569050	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PKM-223	ENST00000569050	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.14	■■■□□ 2.09
PKM-223	ENST00000569050	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PKM-223	ENST00000569050	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
PKM-223	ENST00000569050	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PKM-223	ENST00000569050	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
PKM-223	ENST00000569050	PKD2	Q13563	968 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PKM-223	ENST00000569050	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PKM-223	ENST00000569050	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.01	■■■□□ 2.08
PKM-223	ENST00000569050	HSPA1L	P34931	641 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PKM-223	ENST00000569050	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PKM-223	ENST00000569050	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PKM-223	ENST00000569050	A2M	P01023	1474 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PKM-223	ENST00000569050	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07
PKM-223	ENST00000569050	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.07
PKM-223	ENST00000569050	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.07
PKM-223	ENST00000569050	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PKM-223	ENST00000569050	PIP4K2B	P78356	416 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PKM-223	ENST00000569050	GGT6	Q6P531	493 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PKM-223	ENST00000569050	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PKM-223	ENST00000569050	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PKM-223	ENST00000569050	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PKM-223	ENST00000569050	CPS1	P31327	1500 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PKM-223	ENST00000569050	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PKM-223	ENST00000569050	TOM1	O60784	492 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PKM-223	ENST00000569050	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PKM-223	ENST00000569050	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PKM-223	ENST00000569050	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PKM-223	ENST00000569050	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PKM-223	ENST00000569050	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PKM-223	ENST00000569050	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PKM-223	ENST00000569050	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PKM-223	ENST00000569050	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04

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