RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558139.1

LHX4-202, Transcript of LIM homeobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene LHX4, Length 721 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4-202ENST00000558139 PTPRTO14522 1441 aa30.15■■■□□ 2.42
LHX4-202ENST00000558139 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.15■■■□□ 2.42
LHX4-202ENST00000558139 STRCQ7RTU9 1775 aa30.13■■■□□ 2.41
LHX4-202ENST00000558139 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.13■■■□□ 2.41
LHX4-202ENST00000558139 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
LHX4-202ENST00000558139 ATP10AO60312 1499 aa30.1■■■□□ 2.41
LHX4-202ENST00000558139 HECW1Q76N89 1606 aa30.08■■■□□ 2.41
LHX4-202ENST00000558139 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.08■■■□□ 2.41
LHX4-202ENST00000558139 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.07■■■□□ 2.4
LHX4-202ENST00000558139 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.06■■■□□ 2.4
LHX4-202ENST00000558139 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
LHX4-202ENST00000558139 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.01■■■□□ 2.39
LHX4-202ENST00000558139 SAMD9Q5K651 1589 aa30.01■■■□□ 2.39
LHX4-202ENST00000558139 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
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LHX4-202ENST00000558139 PLCH2O75038 1416 aa29.94■■■□□ 2.38
LHX4-202ENST00000558139 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
LHX4-202ENST00000558139 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
LHX4-202ENST00000558139 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.91■■■□□ 2.38
LHX4-202ENST00000558139 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.88■■■□□ 2.37
LHX4-202ENST00000558139 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.87■■■□□ 2.37
LHX4-202ENST00000558139 NCOA1Q15788 1441 aa29.86■■■□□ 2.37
LHX4-202ENST00000558139 AFAP1Q8N556 730 aa29.81■■■□□ 2.36
LHX4-202ENST00000558139 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.79■■■□□ 2.36
LHX4-202ENST00000558139 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.78■■■□□ 2.36
LHX4-202ENST00000558139 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
LHX4-202ENST00000558139 C3P01024 1663 aa29.72■■■□□ 2.35
LHX4-202ENST00000558139 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.71■■■□□ 2.35
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LHX4-202ENST00000558139 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.67■■■□□ 2.34
LHX4-202ENST00000558139 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
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LHX4-202ENST00000558139 REREQ9P2R6 1566 aa29.67■■■□□ 2.34
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LHX4-202ENST00000558139 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
LHX4-202ENST00000558139 PKD2Q13563 968 aa29.65■■■□□ 2.34
LHX4-202ENST00000558139 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
LHX4-202ENST00000558139 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.64■■■□□ 2.34
LHX4-202ENST00000558139 AGLP35573 1532 aa29.64■■■□□ 2.34
LHX4-202ENST00000558139 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
LHX4-202ENST00000558139 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
LHX4-202ENST00000558139 NPATQ14207 1427 aa29.62■■■□□ 2.33
LHX4-202ENST00000558139 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
LHX4-202ENST00000558139 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.61■■■□□ 2.33
LHX4-202ENST00000558139 PIP4K2BP78356 416 aa29.59■■■□□ 2.33
LHX4-202ENST00000558139 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.59■■■□□ 2.33
LHX4-202ENST00000558139 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.59■■■□□ 2.33
LHX4-202ENST00000558139 TOM1O60784 492 aa29.58■■■□□ 2.33
LHX4-202ENST00000558139 ZMYM3Q14202 1370 aa29.54■■■□□ 2.32
LHX4-202ENST00000558139 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.54■■■□□ 2.32
LHX4-202ENST00000558139 ABCA6Q8N139 1617 aa29.53■■■□□ 2.32
LHX4-202ENST00000558139 PLA2R1Q13018 1463 aa29.52■■■□□ 2.32
LHX4-202ENST00000558139 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
LHX4-202ENST00000558139 KIF14Q15058 1648 aa29.45■■■□□ 2.3
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LHX4-202ENST00000558139 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
LHX4-202ENST00000558139 FMN1Q68DA7 1419 aa29.4■■■□□ 2.3
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LHX4-202ENST00000558139 EEA1Q15075 1411 aa29.36■■■□□ 2.29
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LHX4-202ENST00000558139 ABCC1P33527 1531 aa29.33■■■□□ 2.29
LHX4-202ENST00000558139 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.31■■■□□ 2.28
LHX4-202ENST00000558139 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
LHX4-202ENST00000558139 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.31■■■□□ 2.28
LHX4-202ENST00000558139 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.28■■■□□ 2.28
LHX4-202ENST00000558139 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
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LHX4-202ENST00000558139 GGT6Q6P531 493 aa29.26■■■□□ 2.27
LHX4-202ENST00000558139 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
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LHX4-202ENST00000558139 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.22■■■□□ 2.27
LHX4-202ENST00000558139 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
LHX4-202ENST00000558139 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
LHX4-202ENST00000558139 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
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LHX4-202ENST00000558139 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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LHX4-202ENST00000558139 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
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LHX4-202ENST00000558139 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
LHX4-202ENST00000558139 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.04■■■□□ 2.24
LHX4-202ENST00000558139 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
LHX4-202ENST00000558139 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
LHX4-202ENST00000558139 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
LHX4-202ENST00000558139 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
LHX4-202ENST00000558139 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.01■■■□□ 2.23
LHX4-202ENST00000558139 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.99■■■□□ 2.23
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