RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557119.2

PITX2-209, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PITX2, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-209ENST00000557119 KDM6BO15054 1643 aa32.02■■■□□ 2.72
PITX2-209ENST00000557119 JPH4Q96JJ6 628 aa32.02■■■□□ 2.72
PITX2-209ENST00000557119 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.01■■■□□ 2.72
PITX2-209ENST00000557119 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.98■■■□□ 2.71
PITX2-209ENST00000557119 ABCA8O94911 1581 aa31.96■■■□□ 2.71
PITX2-209ENST00000557119 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
PITX2-209ENST00000557119 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.95■■■□□ 2.7
PITX2-209ENST00000557119 ARID3CA6NKF2 412 aa31.93■■■□□ 2.7
PITX2-209ENST00000557119 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
PITX2-209ENST00000557119 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
PITX2-209ENST00000557119 TRIM52Q96A61 297 aa31.91■■■□□ 2.7
PITX2-209ENST00000557119 ADGRL2O95490 1459 aa31.89■■■□□ 2.7
PITX2-209ENST00000557119 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.89■■■□□ 2.7
PITX2-209ENST00000557119 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.88■■■□□ 2.69
PITX2-209ENST00000557119 CCER2I3L3R5 266 aa31.85■■■□□ 2.69
PITX2-209ENST00000557119 KIF14Q15058 1648 aa31.84■■■□□ 2.69
PITX2-209ENST00000557119 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.84■■■□□ 2.69
PITX2-209ENST00000557119 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.84■■■□□ 2.69
PITX2-209ENST00000557119 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
PITX2-209ENST00000557119 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.83■■■□□ 2.69
PITX2-209ENST00000557119 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
PITX2-209ENST00000557119 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.82■■■□□ 2.68
PITX2-209ENST00000557119 NCOA1Q15788 1441 aa31.81■■■□□ 2.68
PITX2-209ENST00000557119 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
PITX2-209ENST00000557119 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.79■■■□□ 2.68
PITX2-209ENST00000557119 ATP10BO94823 1461 aa31.78■■■□□ 2.68
PITX2-209ENST00000557119 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.75■■■□□ 2.67
PITX2-209ENST00000557119 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.74■■■□□ 2.67
PITX2-209ENST00000557119 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.74■■■□□ 2.67
PITX2-209ENST00000557119 ANP32CO43423 234 aa31.72■■■□□ 2.67
PITX2-209ENST00000557119 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.69■■■□□ 2.66
PITX2-209ENST00000557119 PZPP20742 1482 aa31.69■■■□□ 2.66
PITX2-209ENST00000557119 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
PITX2-209ENST00000557119 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.68■■■□□ 2.66
PITX2-209ENST00000557119 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.67■■■□□ 2.66
PITX2-209ENST00000557119 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
PITX2-209ENST00000557119 PTPRGP23470 1445 aa31.64■■■□□ 2.66
PITX2-209ENST00000557119 KCNH8Q96L42 1107 aa31.63■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.63■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 SHROOM2Q13796 1616 aa31.62■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.61■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.61■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.58■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.57■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.57■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.57■■■□□ 2.65
PITX2-209ENST00000557119 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.56■■■□□ 2.64
PITX2-209ENST00000557119 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.55■■■□□ 2.64
PITX2-209ENST00000557119 FOXD1Q16676 465 aa31.55■■■□□ 2.64
PITX2-209ENST00000557119 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.53■■■□□ 2.64
PITX2-209ENST00000557119 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
PITX2-209ENST00000557119 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.52■■■□□ 2.64
PITX2-209ENST00000557119 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.5■■■□□ 2.63
PITX2-209ENST00000557119 PREX2Q70Z35 1606 aa31.48■■■□□ 2.63
PITX2-209ENST00000557119 MBD5Q9P267 1494 aa31.48■■■□□ 2.63
PITX2-209ENST00000557119 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.47■■■□□ 2.63
PITX2-209ENST00000557119 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
PITX2-209ENST00000557119 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
PITX2-209ENST00000557119 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.45■■■□□ 2.63
PITX2-209ENST00000557119 TSPY4P0CV99 314 aa31.44■■■□□ 2.62
PITX2-209ENST00000557119 TSPY10P0CW01 314 aa31.44■■■□□ 2.62
PITX2-209ENST00000557119 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.44■■■□□ 2.62
PITX2-209ENST00000557119 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.43■■■□□ 2.62
PITX2-209ENST00000557119 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.42■■■□□ 2.62
PITX2-209ENST00000557119 CCDC7Q96M83 1385 aa31.4■■■□□ 2.62
PITX2-209ENST00000557119 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.4■■■□□ 2.62
PITX2-209ENST00000557119 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.39■■■□□ 2.62
PITX2-209ENST00000557119 PKD2Q13563 968 aa31.38■■■□□ 2.61
PITX2-209ENST00000557119 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.37■■■□□ 2.61
PITX2-209ENST00000557119 ABCC2Q92887 1545 aa31.37■■■□□ 2.61
PITX2-209ENST00000557119 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.35■■■□□ 2.61
PITX2-209ENST00000557119 KIF15Q9NS87 1388 aa31.34■■■□□ 2.61
PITX2-209ENST00000557119 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.34■■■□□ 2.61
PITX2-209ENST00000557119 NUP155O75694 1391 aa31.33■■■□□ 2.61
PITX2-209ENST00000557119 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.3■■■□□ 2.6
PITX2-209ENST00000557119 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
PITX2-209ENST00000557119 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
PITX2-209ENST00000557119 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
PITX2-209ENST00000557119 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.26■■■□□ 2.59
PITX2-209ENST00000557119 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
PITX2-209ENST00000557119 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.24■■■□□ 2.59
PITX2-209ENST00000557119 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.23■■■□□ 2.59
PITX2-209ENST00000557119 PLXNC1O60486 1568 aa31.21■■■□□ 2.59
PITX2-209ENST00000557119 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.21■■■□□ 2.59
PITX2-209ENST00000557119 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.2■■■□□ 2.58
PITX2-209ENST00000557119 UNC13BO14795 1591 aa31.19■■■□□ 2.58
PITX2-209ENST00000557119 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.19■■■□□ 2.58
PITX2-209ENST00000557119 KDM5CP41229 1560 aa31.18■■■□□ 2.58
PITX2-209ENST00000557119 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.18■■■□□ 2.58
PITX2-209ENST00000557119 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.17■■■□□ 2.58
PITX2-209ENST00000557119 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PITX2-209ENST00000557119 USP47Q96K76 1375 aa31.14■■■□□ 2.57
PITX2-209ENST00000557119 PLCH2O75038 1416 aa31.11■■■□□ 2.57
PITX2-209ENST00000557119 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
PITX2-209ENST00000557119 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.07■■■□□ 2.56
PITX2-209ENST00000557119 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.07■■■□□ 2.56
PITX2-209ENST00000557119 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.06■■■□□ 2.56
PITX2-209ENST00000557119 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.06■■■□□ 2.56
PITX2-209ENST00000557119 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms