RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 GRIN2BQ13224 1484 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 FGD1P98174 961 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 ANP32CO43423 234 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 ZMYND15Q9H091 742 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 POGKQ9P215 609 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 PSMD1Q99460 953 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 PIP4K2BP78356 416 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-210ENST00000551525 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 CFTRP13569 1480 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 WIZO95785 1651 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO41Q8TF61 875 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP53Q96M91 514 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 CLSTN1O94985 981 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 GGT6Q6P531 493 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 ARID3AQ99856 593 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 FKBP8Q14318 412 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 UACAQ9BZF9 1416 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-210ENST00000551525 NPHP1O15259 732 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 WWC1Q8IX03 1113 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 SYNJ2O15056 1496 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 SYNJ1O43426 1573 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 NGLY1Q96IV0 654 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 TAF3Q5VWG9 929 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 ATF3P18847 181 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 NUDCQ9Y266 331 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 KCNA4P22459 653 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 KIF3BO15066 747 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 CLGNO14967 610 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 TOPBP1Q92547 1522 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 TMC1Q8TDI8 760 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 MAP7D2Q96T17 732 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-210ENST00000551525 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 STAC3Q96MF2 364 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 USP35Q9P2H5 1018 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 AAMPQ13685 434 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 NBPF14Q5TI25 921 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.06□□□□□ -1.12
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