RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.51■■□□□ 1.67
USP15-216ENST00000550632 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.51■■□□□ 1.67
USP15-216ENST00000550632 SAMD9Q5K651 1589 aa25.5■■□□□ 1.67
USP15-216ENST00000550632 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
USP15-216ENST00000550632 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.49■■□□□ 1.67
USP15-216ENST00000550632 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.48■■□□□ 1.67
USP15-216ENST00000550632 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
USP15-216ENST00000550632 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.44■■□□□ 1.66
USP15-216ENST00000550632 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.43■■□□□ 1.66
USP15-216ENST00000550632 ATP10AO60312 1499 aa25.42■■□□□ 1.66
USP15-216ENST00000550632 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.39■■□□□ 1.66
USP15-216ENST00000550632 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.39■■□□□ 1.66
USP15-216ENST00000550632 PTPRTO14522 1441 aa25.38■■□□□ 1.65
USP15-216ENST00000550632 PLCH2O75038 1416 aa25.29■■□□□ 1.64
USP15-216ENST00000550632 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
USP15-216ENST00000550632 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.27■■□□□ 1.64
USP15-216ENST00000550632 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USP15-216ENST00000550632 C3P01024 1663 aa25.24■■□□□ 1.63
USP15-216ENST00000550632 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.24■■□□□ 1.63
USP15-216ENST00000550632 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.23■■□□□ 1.63
USP15-216ENST00000550632 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.22■■□□□ 1.63
USP15-216ENST00000550632 AFAP1Q8N556 730 aa25.22■■□□□ 1.63
USP15-216ENST00000550632 NCOA1Q15788 1441 aa25.21■■□□□ 1.63
USP15-216ENST00000550632 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.2■■□□□ 1.62
USP15-216ENST00000550632 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
USP15-216ENST00000550632 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.17■■□□□ 1.62
USP15-216ENST00000550632 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.16■■□□□ 1.62
USP15-216ENST00000550632 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
USP15-216ENST00000550632 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.16■■□□□ 1.62
USP15-216ENST00000550632 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.15■■□□□ 1.62
USP15-216ENST00000550632 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.14■■□□□ 1.62
USP15-216ENST00000550632 KDM5CP41229 1560 aa25.13■■□□□ 1.61
USP15-216ENST00000550632 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.12■■□□□ 1.61
USP15-216ENST00000550632 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
USP15-216ENST00000550632 ABCA6Q8N139 1617 aa25.11■■□□□ 1.61
USP15-216ENST00000550632 KIF14Q15058 1648 aa25.08■■□□□ 1.61
USP15-216ENST00000550632 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.08■■□□□ 1.61
USP15-216ENST00000550632 REREQ9P2R6 1566 aa25.07■■□□□ 1.6
USP15-216ENST00000550632 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
USP15-216ENST00000550632 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
USP15-216ENST00000550632 HSPA1LP34931 641 aa25.04■■□□□ 1.6
USP15-216ENST00000550632 AGLP35573 1532 aa25.02■■□□□ 1.6
USP15-216ENST00000550632 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.01■■□□□ 1.59
USP15-216ENST00000550632 PIP4K2BP78356 416 aa25■■□□□ 1.59
USP15-216ENST00000550632 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.99■■□□□ 1.59
USP15-216ENST00000550632 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
USP15-216ENST00000550632 NPATQ14207 1427 aa24.95■■□□□ 1.59
USP15-216ENST00000550632 ZMYM3Q14202 1370 aa24.93■■□□□ 1.58
USP15-216ENST00000550632 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
USP15-216ENST00000550632 PKD2Q13563 968 aa24.92■■□□□ 1.58
USP15-216ENST00000550632 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.92■■□□□ 1.58
USP15-216ENST00000550632 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.9■■□□□ 1.58
USP15-216ENST00000550632 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
USP15-216ENST00000550632 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.9■■□□□ 1.58
USP15-216ENST00000550632 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 MROH2AA6NES4 1674 aa24.88■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 ABCC1P33527 1531 aa24.88■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 PLA2R1Q13018 1463 aa24.88■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.87■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.87■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.87■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 CLIP1P30622 1438 aa24.86■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 FMN1Q68DA7 1419 aa24.84■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 TOM1O60784 492 aa24.83■■□□□ 1.57
USP15-216ENST00000550632 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
USP15-216ENST00000550632 PREX2Q70Z35 1606 aa24.81■■□□□ 1.56
USP15-216ENST00000550632 EEA1Q15075 1411 aa24.8■■□□□ 1.56
USP15-216ENST00000550632 PTPRKQ15262 1439 aa24.8■■□□□ 1.56
USP15-216ENST00000550632 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.79■■□□□ 1.56
USP15-216ENST00000550632 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.77■■□□□ 1.56
USP15-216ENST00000550632 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.77■■□□□ 1.56
USP15-216ENST00000550632 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
USP15-216ENST00000550632 GGT6Q6P531 493 aa24.74■■□□□ 1.55
USP15-216ENST00000550632 CPS1P31327 1500 aa24.72■■□□□ 1.55
USP15-216ENST00000550632 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.72■■□□□ 1.55
USP15-216ENST00000550632 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
USP15-216ENST00000550632 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
USP15-216ENST00000550632 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.546e-7■■■■□ 20.9
USP15-216ENST00000550632 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.69■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.69■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 ALKQ9UM73 1620 aa24.68■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.68■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.67■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 ATP7AQ04656 1500 aa24.65■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 A2MP01023 1474 aa24.64■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 PLXNC1O60486 1568 aa24.64■■□□□ 1.54
USP15-216ENST00000550632 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
USP15-216ENST00000550632 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.6■■□□□ 1.53
USP15-216ENST00000550632 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
USP15-216ENST00000550632 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
USP15-216ENST00000550632 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
USP15-216ENST00000550632 TNRQ92752 1358 aa24.55■■□□□ 1.52
USP15-216ENST00000550632 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.55■■□□□ 1.52
USP15-216ENST00000550632 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
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