RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 HECW1Q76N89 1606 aa40.57■■■■■ 4.09
PRDM4-202ENST00000547188 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.57■■■■■ 4.09
PRDM4-202ENST00000547188 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.53■■■■■ 4.08
PRDM4-202ENST00000547188 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.52■■■■■ 4.08
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.52■■■■■ 4.08
PRDM4-202ENST00000547188 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.51■■■■■ 4.08
PRDM4-202ENST00000547188 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
PRDM4-202ENST00000547188 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.39■■■■■ 4.06
PRDM4-202ENST00000547188 ATP10AO60312 1499 aa40.39■■■■■ 4.06
PRDM4-202ENST00000547188 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.38■■■■■ 4.05
PRDM4-202ENST00000547188 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
PRDM4-202ENST00000547188 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.34■■■■■ 4.05
PRDM4-202ENST00000547188 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.33■■■■■ 4.05
PRDM4-202ENST00000547188 PTPRTO14522 1441 aa40.33■■■■■ 4.05
PRDM4-202ENST00000547188 PLCH2O75038 1416 aa40.2■■■■■ 4.03
PRDM4-202ENST00000547188 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.19■■■■■ 4.02
PRDM4-202ENST00000547188 C3P01024 1663 aa40.18■■■■■ 4.02
PRDM4-202ENST00000547188 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
PRDM4-202ENST00000547188 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.07■■■■■ 4
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PRDM4-202ENST00000547188 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.05■■■■■ 4
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PRDM4-202ENST00000547188 AFAP1Q8N556 730 aa40.03■■■■■ 4
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PRDM4-202ENST00000547188 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.01■■■■■ 4
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PRDM4-202ENST00000547188 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.98■■■■□ 3.99
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PRDM4-202ENST00000547188 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
PRDM4-202ENST00000547188 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.92■■■■□ 3.98
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PRDM4-202ENST00000547188 KIF14Q15058 1648 aa39.88■■■■□ 3.97
PRDM4-202ENST00000547188 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.87■■■■□ 3.97
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PRDM4-202ENST00000547188 AGLP35573 1532 aa39.8■■■■□ 3.96
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PRDM4-202ENST00000547188 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.72■■■■□ 3.95
PRDM4-202ENST00000547188 HSPA1LP34931 641 aa39.7■■■■□ 3.95
PRDM4-202ENST00000547188 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.7■■■■□ 3.95
PRDM4-202ENST00000547188 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
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PRDM4-202ENST00000547188 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
PRDM4-202ENST00000547188 MROH2AA6NES4 1674 aa39.64■■■■□ 3.94
PRDM4-202ENST00000547188 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.64■■■■□ 3.94
PRDM4-202ENST00000547188 PIP4K2BP78356 416 aa39.62■■■■□ 3.93
PRDM4-202ENST00000547188 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
PRDM4-202ENST00000547188 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.6■■■■□ 3.93
PRDM4-202ENST00000547188 ZMYM3Q14202 1370 aa39.6■■■■□ 3.93
PRDM4-202ENST00000547188 PKD2Q13563 968 aa39.58■■■■□ 3.93
PRDM4-202ENST00000547188 ABCC1P33527 1531 aa39.57■■■■□ 3.93
PRDM4-202ENST00000547188 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.57■■■■□ 3.92
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
PRDM4-202ENST00000547188 PLA2R1Q13018 1463 aa39.56■■■■□ 3.92
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PRDM4-202ENST00000547188 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.51■■■■□ 3.92
PRDM4-202ENST00000547188 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.51■■■■□ 3.91
PRDM4-202ENST00000547188 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.91
PRDM4-202ENST00000547188 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
PRDM4-202ENST00000547188 FMN1Q68DA7 1419 aa39.5■■■■□ 3.91
PRDM4-202ENST00000547188 PREX2Q70Z35 1606 aa39.5■■■■□ 3.91
PRDM4-202ENST00000547188 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
PRDM4-202ENST00000547188 EEA1Q15075 1411 aa39.48■■■■□ 3.91
PRDM4-202ENST00000547188 TOM1O60784 492 aa39.43■■■■□ 3.9
PRDM4-202ENST00000547188 PTPRKQ15262 1439 aa39.4■■■■□ 3.9
PRDM4-202ENST00000547188 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.39■■■■□ 3.9
PRDM4-202ENST00000547188 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.38■■■■□ 3.89
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.36■■■■□ 3.89
PRDM4-202ENST00000547188 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.34■■■■□ 3.89
PRDM4-202ENST00000547188 CPS1P31327 1500 aa39.3■■■■□ 3.88
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
PRDM4-202ENST00000547188 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
PRDM4-202ENST00000547188 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
PRDM4-202ENST00000547188 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
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PRDM4-202ENST00000547188 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.25■■■■□ 3.87
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PRDM4-202ENST00000547188 VWDEQ8N2E2 1590 aa39.11■■■■□ 3.85
PRDM4-202ENST00000547188 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
PRDM4-202ENST00000547188 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.03■■■■□ 3.84
PRDM4-202ENST00000547188 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
PRDM4-202ENST00000547188 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
PRDM4-202ENST00000547188 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.99■■■■□ 3.83
PRDM4-202ENST00000547188 TNRQ92752 1358 aa38.98■■■■□ 3.83
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