RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.85■■■□□ 2.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.83■■■□□ 2.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 HECW1Q76N89 1606 aa31.83■■■□□ 2.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.83■■■□□ 2.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.83■■■□□ 2.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 ILDR2Q71H61 639 aa31.81■■■□□ 2.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP10AO60312 1499 aa31.8■■■□□ 2.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.79■■■□□ 2.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLCH2O75038 1416 aa31.78■■■□□ 2.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.77■■■□□ 2.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.76■■■□□ 2.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.72■■■□□ 2.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.69■■■□□ 2.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 STRCQ7RTU9 1775 aa31.64■■■□□ 2.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPRTO14522 1441 aa31.62■■■□□ 2.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.61■■■□□ 2.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.56■■■□□ 2.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.55■■■□□ 2.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 AFAP1Q8N556 730 aa31.54■■■□□ 2.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.53■■■□□ 2.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
CD27-AS1-208ENST00000538616 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.5■■■□□ 2.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 KDM5CP41229 1560 aa31.5■■■□□ 2.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 FMN1Q68DA7 1419 aa31.48■■■□□ 2.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 REREQ9P2R6 1566 aa31.47■■■□□ 2.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.46■■■□□ 2.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.44■■■□□ 2.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.42■■■□□ 2.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.42■■■□□ 2.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.42■■■□□ 2.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF14Q15058 1648 aa31.41■■■□□ 2.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLIP1P30622 1438 aa31.41■■■□□ 2.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 C3P01024 1663 aa31.4■■■□□ 2.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 AGLP35573 1532 aa31.39■■■□□ 2.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 NCOA1Q15788 1441 aa31.37■■■□□ 2.61
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.37■■■□□ 2.61
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.37■■■□□ 2.61
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCA6Q8N139 1617 aa31.31■■■□□ 2.6
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPATQ14207 1427 aa31.27■■■□□ 2.6
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.22■■■□□ 2.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.22■■■□□ 2.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.21■■■□□ 2.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCC1P33527 1531 aa31.2■■■□□ 2.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 PKD2Q13563 968 aa31.19■■■□□ 2.58
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZMYM3Q14202 1370 aa31.18■■■□□ 2.58
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CD27-AS1-208ENST00000538616 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.17■■■□□ 2.58
CD27-AS1-208ENST00000538616 PREX2Q70Z35 1606 aa31.16■■■□□ 2.58
CD27-AS1-208ENST00000538616 MROH2AA6NES4 1674 aa31.15■■■□□ 2.58
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.15■■■□□ 2.58
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.13■■■□□ 2.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLA2R1Q13018 1463 aa31.11■■■□□ 2.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.07■■■□□ 2.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.07■■■□□ 2.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.04■■■□□ 2.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.02■■■□□ 2.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.99■■■□□ 2.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.98■■■□□ 2.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPRKQ15262 1439 aa30.98■■■□□ 2.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.96■■■□□ 2.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.96■■■□□ 2.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TOM1O60784 492 aa30.95■■■□□ 2.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 GGT6Q6P531 493 aa30.94■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 A2MP01023 1474 aa30.93■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.93■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.92■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSPA1LP34931 641 aa30.91■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP7AQ04656 1500 aa30.91■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 CEP162Q5TB80 1403 aa30.9■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.9■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLXNC1O60486 1568 aa30.89■■■□□ 2.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIP4K2BP78356 416 aa30.88■■■□□ 2.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.87■■■□□ 2.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.86■■■□□ 2.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 CPS1P31327 1500 aa30.84■■■□□ 2.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.77■■■□□ 2.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.77■■■□□ 2.52
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