RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529673.5

SNX15-206, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 3

Gene SNX15, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-206ENST00000529673 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SNX15-206ENST00000529673 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.44■■□□□ 1.18
SNX15-206ENST00000529673 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.44■■□□□ 1.18
SNX15-206ENST00000529673 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.43■■□□□ 1.18
SNX15-206ENST00000529673 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.43■■□□□ 1.18
SNX15-206ENST00000529673 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.41■■□□□ 1.18
SNX15-206ENST00000529673 MLECQ14165 292 aa22.41■■□□□ 1.18
SNX15-206ENST00000529673 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
SNX15-206ENST00000529673 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.38■■□□□ 1.17
SNX15-206ENST00000529673 HECW1Q76N89 1606 aa22.37■■□□□ 1.17
SNX15-206ENST00000529673 STRCQ7RTU9 1775 aa22.33■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.32■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.32■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 ATP10AO60312 1499 aa22.32■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.3■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.29■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 PTPRTO14522 1441 aa22.29■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.27■■□□□ 1.16
SNX15-206ENST00000529673 PLCH2O75038 1416 aa22.25■■□□□ 1.15
SNX15-206ENST00000529673 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SNX15-206ENST00000529673 FMN1Q68DA7 1419 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX15-206ENST00000529673 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.2■■□□□ 1.14
SNX15-206ENST00000529673 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX15-206ENST00000529673 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX15-206ENST00000529673 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-206ENST00000529673 KDM5CP41229 1560 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-206ENST00000529673 REREQ9P2R6 1566 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-206ENST00000529673 NCOA1Q15788 1441 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-206ENST00000529673 C3P01024 1663 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-206ENST00000529673 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-206ENST00000529673 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-206ENST00000529673 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.09■■□□□ 1.13
SNX15-206ENST00000529673 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SNX15-206ENST00000529673 KIF14Q15058 1648 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX15-206ENST00000529673 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX15-206ENST00000529673 AGLP35573 1532 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX15-206ENST00000529673 AFAP1Q8N556 730 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX15-206ENST00000529673 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNX15-206ENST00000529673 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX15-206ENST00000529673 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX15-206ENST00000529673 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX15-206ENST00000529673 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SNX15-206ENST00000529673 ABCA6Q8N139 1617 aa22.02■■□□□ 1.11
SNX15-206ENST00000529673 CLIP1P30622 1438 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX15-206ENST00000529673 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22■■□□□ 1.11
SNX15-206ENST00000529673 UBAP1LF5GYI3 381 aa22■■□□□ 1.11
SNX15-206ENST00000529673 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX15-206ENST00000529673 NPATQ14207 1427 aa21.98■■□□□ 1.11
SNX15-206ENST00000529673 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SNX15-206ENST00000529673 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.95■■□□□ 1.1
SNX15-206ENST00000529673 MROH2AA6NES4 1674 aa21.92■■□□□ 1.1
SNX15-206ENST00000529673 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.92■■□□□ 1.1
SNX15-206ENST00000529673 PLA2R1Q13018 1463 aa21.91■■□□□ 1.1
SNX15-206ENST00000529673 ABCC1P33527 1531 aa21.9■■□□□ 1.1
SNX15-206ENST00000529673 PKD2Q13563 968 aa21.9■■□□□ 1.1
SNX15-206ENST00000529673 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.89■■□□□ 1.1
SNX15-206ENST00000529673 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SNX15-206ENST00000529673 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.87■■□□□ 1.09
SNX15-206ENST00000529673 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SNX15-206ENST00000529673 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.86■■□□□ 1.09
SNX15-206ENST00000529673 ZMYM3Q14202 1370 aa21.86■■□□□ 1.09
SNX15-206ENST00000529673 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SNX15-206ENST00000529673 PREX2Q70Z35 1606 aa21.85■■□□□ 1.09
SNX15-206ENST00000529673 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.85■■□□□ 1.09
SNX15-206ENST00000529673 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.84■■□□□ 1.09
SNX15-206ENST00000529673 CEP162Q5TB80 1403 aa21.82■■□□□ 1.08
SNX15-206ENST00000529673 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SNX15-206ENST00000529673 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.81■■□□□ 1.08
SNX15-206ENST00000529673 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.8■■□□□ 1.08
SNX15-206ENST00000529673 HSPA1LP34931 641 aa21.8■■□□□ 1.08
SNX15-206ENST00000529673 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SNX15-206ENST00000529673 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SNX15-206ENST00000529673 TOM1O60784 492 aa21.77■■□□□ 1.08
SNX15-206ENST00000529673 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SNX15-206ENST00000529673 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.76■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 PTPRKQ15262 1439 aa21.76■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.76■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 CPS1P31327 1500 aa21.75■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 PIP4K2BP78356 416 aa21.74■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.74■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SNX15-206ENST00000529673 PLXNC1O60486 1568 aa21.7■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.69■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.69■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.68■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 ATP7AQ04656 1500 aa21.68■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 A2MP01023 1474 aa21.67■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.66■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.65■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SNX15-206ENST00000529673 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SNX15-206ENST00000529673 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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