RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515332.5

SGMS2-209, Transcript of sphingomyelin synthase 2, human

TSL 3

Gene SGMS2, Length 498 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGMS2-209	ENST00000515332	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.96	■■■■■ 4.15
SGMS2-209	ENST00000515332	EEA1	Q15075	1411 aa		40.93	■■■■■ 4.14
SGMS2-209	ENST00000515332	PLCH2	O75038	1416 aa		40.91	■■■■■ 4.14
SGMS2-209	ENST00000515332	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.87	■■■■■ 4.13
SGMS2-209	ENST00000515332	ATP10A	O60312	1499 aa		40.86	■■■■■ 4.13
SGMS2-209	ENST00000515332	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.83	■■■■■ 4.13
SGMS2-209	ENST00000515332	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.13
SGMS2-209	ENST00000515332	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.81	■■■■■ 4.12
SGMS2-209	ENST00000515332	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.76	■■■■■ 4.12
SGMS2-209	ENST00000515332	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
SGMS2-209	ENST00000515332	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.73	■■■■■ 4.11
SGMS2-209	ENST00000515332	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.67	■■■■■ 4.1
SGMS2-209	ENST00000515332	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		40.65	■■■■■ 4.1
SGMS2-209	ENST00000515332	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.65	■■■■■ 4.1
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		40.64	■■■■■ 4.1
SGMS2-209	ENST00000515332	AFAP1	Q8N556	730 aa		40.63	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	KIF14	Q15058	1648 aa		40.63	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.6	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	KDM5C	P41229	1560 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.57	■■■■■ 4.09
SGMS2-209	ENST00000515332	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SGMS2-209	ENST00000515332	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
SGMS2-209	ENST00000515332	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
SGMS2-209	ENST00000515332	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
SGMS2-209	ENST00000515332	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.49	■■■■■ 4.07
SGMS2-209	ENST00000515332	SOCS7	O14512	581 aa		40.46	■■■■■ 4.07
SGMS2-209	ENST00000515332	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SGMS2-209	ENST00000515332	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SGMS2-209	ENST00000515332	CLIP1	P30622	1438 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SGMS2-209	ENST00000515332	C3	P01024	1663 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SGMS2-209	ENST00000515332	PTPRT	O14522	1441 aa		40.44	■■■■■ 4.06
SGMS2-209	ENST00000515332	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SGMS2-209	ENST00000515332	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
SGMS2-209	ENST00000515332	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		40.38	■■■■■ 4.05
SGMS2-209	ENST00000515332	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SGMS2-209	ENST00000515332	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.35	■■■■■ 4.05
SGMS2-209	ENST00000515332	AGL	P35573	1532 aa		40.34	■■■■■ 4.05
SGMS2-209	ENST00000515332	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.33	■■■■■ 4.05
SGMS2-209	ENST00000515332	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.31	■■■■■ 4.04
SGMS2-209	ENST00000515332	ABCC1	P33527	1531 aa		40.3	■■■■■ 4.04
SGMS2-209	ENST00000515332	PREX2	Q70Z35	1606 aa		40.27	■■■■■ 4.04
SGMS2-209	ENST00000515332	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.25	■■■■■ 4.03
SGMS2-209	ENST00000515332	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.25	■■■■■ 4.03
SGMS2-209	ENST00000515332	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.22	■■■■■ 4.03
SGMS2-209	ENST00000515332	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.22	■■■■■ 4.03
SGMS2-209	ENST00000515332	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.19	■■■■■ 4.02
SGMS2-209	ENST00000515332	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.13	■■■■■ 4.02
SGMS2-209	ENST00000515332	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.1	■■■■■ 4.01
SGMS2-209	ENST00000515332	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		40.1	■■■■■ 4.01
SGMS2-209	ENST00000515332	NPAT	Q14207	1427 aa		40.09	■■■■■ 4.01
SGMS2-209	ENST00000515332	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.08	■■■■■ 4.01
SGMS2-209	ENST00000515332	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.07	■■■■■ 4.01
SGMS2-209	ENST00000515332	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.07	■■■■■ 4
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.06	■■■■■ 4
SGMS2-209	ENST00000515332	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.06	■■■■■ 4
SGMS2-209	ENST00000515332	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.06	■■■■■ 4
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.01	■■■■■ 4
SGMS2-209	ENST00000515332	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	39.99	■■■■□ 3.99
SGMS2-209	ENST00000515332	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	39.99	■■■■□ 3.99
SGMS2-209	ENST00000515332	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		39.99	■■■■□ 3.99
SGMS2-209	ENST00000515332	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		39.96	■■■■□ 3.99
SGMS2-209	ENST00000515332	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	39.96	■■■■□ 3.99
SGMS2-209	ENST00000515332	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	39.93	■■■■□ 3.98
SGMS2-209	ENST00000515332	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		39.91	■■■■□ 3.98
SGMS2-209	ENST00000515332	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	39.9	■■■■□ 3.98
SGMS2-209	ENST00000515332	ATP7A	Q04656	1500 aa		39.89	■■■■□ 3.98
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	39.89	■■■■□ 3.98
SGMS2-209	ENST00000515332	PLA2R1	Q13018	1463 aa		39.88	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	PKD2	Q13563	968 aa		39.87	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	PTPRK	Q15262	1439 aa		39.86	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		39.86	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	PLXNC1	O60486	1568 aa		39.85	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	39.85	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	A2M	P01023	1474 aa		39.85	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	39.83	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	GGT6	Q6P531	493 aa		39.83	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	39.82	■■■■□ 3.97
SGMS2-209	ENST00000515332	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		39.81	■■■■□ 3.96
SGMS2-209	ENST00000515332	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		39.79	■■■■□ 3.96
SGMS2-209	ENST00000515332	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	39.78	■■■■□ 3.96
SGMS2-209	ENST00000515332	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		39.75	■■■■□ 3.95
SGMS2-209	ENST00000515332	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		39.75	■■■■□ 3.95
SGMS2-209	ENST00000515332	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		39.71	■■■■□ 3.95
SGMS2-209	ENST00000515332	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		39.65	■■■■□ 3.94
SGMS2-209	ENST00000515332	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		39.64	■■■■□ 3.94
SGMS2-209	ENST00000515332	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	39.63	■■■■□ 3.93
SGMS2-209	ENST00000515332	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	39.63	■■■■□ 3.93
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	39.6	■■■■□ 3.93
SGMS2-209	ENST00000515332	HSPA1L	P34931	641 aa		39.59	■■■■□ 3.93
SGMS2-209	ENST00000515332	PIP4K2B	P78356	416 aa		39.58	■■■■□ 3.93
SGMS2-209	ENST00000515332	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		39.57	■■■■□ 3.92
SGMS2-209	ENST00000515332	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	39.53	■■■■□ 3.92
SGMS2-209	ENST00000515332	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	39.51	■■■■□ 3.92
SGMS2-209	ENST00000515332	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		39.51	■■■■□ 3.92
SGMS2-209	ENST00000515332	MBD5	Q9P267	1494 aa		39.51	■■■■□ 3.92

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