RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.18■■□□□ 1.94
UBE2B-207ENST00000510021 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.17■■□□□ 1.94
UBE2B-207ENST00000510021 HECW1Q76N89 1606 aa27.16■■□□□ 1.94
UBE2B-207ENST00000510021 NCOA1Q15788 1441 aa27.1■■□□□ 1.93
UBE2B-207ENST00000510021 ATP10AO60312 1499 aa27.07■■□□□ 1.92
UBE2B-207ENST00000510021 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.07■■□□□ 1.92
UBE2B-207ENST00000510021 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.02■■□□□ 1.92
UBE2B-207ENST00000510021 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
UBE2B-207ENST00000510021 HSPA1LP34931 641 aa27.01■■□□□ 1.91
UBE2B-207ENST00000510021 C3P01024 1663 aa27.01■■□□□ 1.91
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
UBE2B-207ENST00000510021 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
UBE2B-207ENST00000510021 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
UBE2B-207ENST00000510021 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.919e-7■■■□□ 17.5
UBE2B-207ENST00000510021 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
UBE2B-207ENST00000510021 P3H3Q8IVL6 736 aa26.95■■□□□ 1.9
UBE2B-207ENST00000510021 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
UBE2B-207ENST00000510021 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.93■■□□□ 1.9
UBE2B-207ENST00000510021 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.92■■□□□ 1.9
UBE2B-207ENST00000510021 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.92■■□□□ 1.9
UBE2B-207ENST00000510021 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
UBE2B-207ENST00000510021 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.84■■□□□ 1.89
UBE2B-207ENST00000510021 SAMD9Q5K651 1589 aa26.84■■□□□ 1.89
UBE2B-207ENST00000510021 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.82■■□□□ 1.88
UBE2B-207ENST00000510021 PIP4K2BP78356 416 aa26.81■■□□□ 1.88
UBE2B-207ENST00000510021 REREQ9P2R6 1566 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2B-207ENST00000510021 PLCH2O75038 1416 aa26.76■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 PRXQ9BXM0 1461 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 TOM1O60784 492 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 AGLP35573 1532 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 KDM5CP41229 1560 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 PLA2R1Q13018 1463 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 NPATQ14207 1427 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2B-207ENST00000510021 PKD2Q13563 968 aa26.7■■□□□ 1.86
UBE2B-207ENST00000510021 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
UBE2B-207ENST00000510021 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2B-207ENST00000510021 ABCA6Q8N139 1617 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
UBE2B-207ENST00000510021 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
UBE2B-207ENST00000510021 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2B-207ENST00000510021 ALKQ9UM73 1620 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2B-207ENST00000510021 CPS1P31327 1500 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2B-207ENST00000510021 MROH2AA6NES4 1674 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2B-207ENST00000510021 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2B-207ENST00000510021 AFAP1Q8N556 730 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2B-207ENST00000510021 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
UBE2B-207ENST00000510021 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.6■■□□□ 1.85
UBE2B-207ENST00000510021 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2B-207ENST00000510021 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
UBE2B-207ENST00000510021 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2B-207ENST00000510021 PTPRKQ15262 1439 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2B-207ENST00000510021 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2B-207ENST00000510021 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
UBE2B-207ENST00000510021 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2B-207ENST00000510021 ZMYM3Q14202 1370 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2B-207ENST00000510021 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
UBE2B-207ENST00000510021 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2B-207ENST00000510021 POTEAQ6S8J7 498 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2B-207ENST00000510021 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
UBE2B-207ENST00000510021 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.4■■□□□ 1.82
UBE2B-207ENST00000510021 KIF14Q15058 1648 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2B-207ENST00000510021 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2B-207ENST00000510021 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
UBE2B-207ENST00000510021 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
UBE2B-207ENST00000510021 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
UBE2B-207ENST00000510021 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.35■■□□□ 1.81
UBE2B-207ENST00000510021 ABCC1P33527 1531 aa26.31■■□□□ 1.8
UBE2B-207ENST00000510021 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
UBE2B-207ENST00000510021 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.31■■□□□ 1.8
UBE2B-207ENST00000510021 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
UBE2B-207ENST00000510021 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.29■■□□□ 1.8
UBE2B-207ENST00000510021 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.23■■□□□ 1.79
UBE2B-207ENST00000510021 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.22■■□□□ 1.79
UBE2B-207ENST00000510021 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2B-207ENST00000510021 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
UBE2B-207ENST00000510021 SYNMO15061 1565 aa26.19■■□□□ 1.78
UBE2B-207ENST00000510021 PREX2Q70Z35 1606 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2B-207ENST00000510021 PLXNC1O60486 1568 aa26.17■■□□□ 1.78
UBE2B-207ENST00000510021 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
UBE2B-207ENST00000510021 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.16■■□□□ 1.78
UBE2B-207ENST00000510021 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
UBE2B-207ENST00000510021 MED14O60244 1454 aa26.16■■□□□ 1.78
UBE2B-207ENST00000510021 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
UBE2B-207ENST00000510021 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.13■■□□□ 1.77
UBE2B-207ENST00000510021 DEPDC5O75140 1603 aa26.13■■□□□ 1.77
UBE2B-207ENST00000510021 CLIP1P30622 1438 aa26.12■■□□□ 1.77
UBE2B-207ENST00000510021 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
UBE2B-207ENST00000510021 IQGAP1P46940 1657 aa26.09■■□□□ 1.77
UBE2B-207ENST00000510021 GGT6Q6P531 493 aa26.07■■□□□ 1.76
UBE2B-207ENST00000510021 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.07■■□□□ 1.76
UBE2B-207ENST00000510021 A2MP01023 1474 aa26.06■■□□□ 1.76
UBE2B-207ENST00000510021 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
UBE2B-207ENST00000510021 TNRQ92752 1358 aa26.06■■□□□ 1.76
UBE2B-207ENST00000510021 ATP7AQ04656 1500 aa26.04■■□□□ 1.76
UBE2B-207ENST00000510021 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
UBE2B-207ENST00000510021 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.02■■□□□ 1.76
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