RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498727.5

ILKAP-210, Transcript of ILK associated serine/threonine phosphatase, humanhuman

TSL 2

Gene ILKAP, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKAP-210ENST00000498727 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.83■■■□□ 2.53
ILKAP-210ENST00000498727 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
ILKAP-210ENST00000498727 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.78■■■□□ 2.52
ILKAP-210ENST00000498727 PLCH2O75038 1416 aa30.78■■■□□ 2.52
ILKAP-210ENST00000498727 ATP10AO60312 1499 aa30.76■■■□□ 2.52
ILKAP-210ENST00000498727 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.76■■■□□ 2.51
ILKAP-210ENST00000498727 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.74■■■□□ 2.51
ILKAP-210ENST00000498727 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
ILKAP-210ENST00000498727 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.73■■■□□ 2.51
ILKAP-210ENST00000498727 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.72■■■□□ 2.51
ILKAP-210ENST00000498727 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.7■■■□□ 2.51
ILKAP-210ENST00000498727 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.69■■■□□ 2.5
ILKAP-210ENST00000498727 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
ILKAP-210ENST00000498727 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
ILKAP-210ENST00000498727 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.64■■■□□ 2.5
ILKAP-210ENST00000498727 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.64■■■□□ 2.49
ILKAP-210ENST00000498727 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.63■■■□□ 2.49
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ILKAP-210ENST00000498727 KIF14Q15058 1648 aa30.61■■■□□ 2.49
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ILKAP-210ENST00000498727 AFAP1Q8N556 730 aa30.53■■■□□ 2.48
ILKAP-210ENST00000498727 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
ILKAP-210ENST00000498727 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.52■■■□□ 2.48
ILKAP-210ENST00000498727 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.49■■■□□ 2.47
ILKAP-210ENST00000498727 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
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ILKAP-210ENST00000498727 C3P01024 1663 aa30.46■■■□□ 2.47
ILKAP-210ENST00000498727 REREQ9P2R6 1566 aa30.46■■■□□ 2.47
ILKAP-210ENST00000498727 SOCS7O14512 581 aa30.46■■■□□ 2.47
ILKAP-210ENST00000498727 PTPRTO14522 1441 aa30.45■■■□□ 2.46
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ILKAP-210ENST00000498727 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.43■■■□□ 2.46
ILKAP-210ENST00000498727 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.41■■■□□ 2.46
ILKAP-210ENST00000498727 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.41■■■□□ 2.46
ILKAP-210ENST00000498727 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.39■■■□□ 2.46
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ILKAP-210ENST00000498727 AGLP35573 1532 aa30.37■■■□□ 2.45
ILKAP-210ENST00000498727 PREX2Q70Z35 1606 aa30.35■■■□□ 2.45
ILKAP-210ENST00000498727 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.33■■■□□ 2.45
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ILKAP-210ENST00000498727 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.33■■■□□ 2.45
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ILKAP-210ENST00000498727 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.3■■■□□ 2.44
ILKAP-210ENST00000498727 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.29■■■□□ 2.44
ILKAP-210ENST00000498727 NCOA1Q15788 1441 aa30.28■■■□□ 2.44
ILKAP-210ENST00000498727 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.26■■■□□ 2.43
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ILKAP-210ENST00000498727 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.22■■■□□ 2.43
ILKAP-210ENST00000498727 MROH2AA6NES4 1674 aa30.21■■■□□ 2.43
ILKAP-210ENST00000498727 NPATQ14207 1427 aa30.2■■■□□ 2.42
ILKAP-210ENST00000498727 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.19■■■□□ 2.42
ILKAP-210ENST00000498727 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
ILKAP-210ENST00000498727 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.16■■■□□ 2.42
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ILKAP-210ENST00000498727 ZMYM3Q14202 1370 aa30.15■■■□□ 2.42
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ILKAP-210ENST00000498727 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.1■■■□□ 2.41
ILKAP-210ENST00000498727 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
ILKAP-210ENST00000498727 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ILKAP-210ENST00000498727 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.07■■■□□ 2.4
ILKAP-210ENST00000498727 PKD2Q13563 968 aa30.06■■■□□ 2.4
ILKAP-210ENST00000498727 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
ILKAP-210ENST00000498727 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
ILKAP-210ENST00000498727 ATP7AQ04656 1500 aa30.05■■■□□ 2.4
ILKAP-210ENST00000498727 PLA2R1Q13018 1463 aa30.03■■■□□ 2.4
ILKAP-210ENST00000498727 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.03■■■□□ 2.4
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ILKAP-210ENST00000498727 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30■■■□□ 2.39
ILKAP-210ENST00000498727 CHIC1Q5VXU3 224 aa30■■■□□ 2.39
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ILKAP-210ENST00000498727 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
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ILKAP-210ENST00000498727 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
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ILKAP-210ENST00000498727 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ILKAP-210ENST00000498727 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.91■■■□□ 2.38
ILKAP-210ENST00000498727 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.86■■■□□ 2.37
ILKAP-210ENST00000498727 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.84■■■□□ 2.37
ILKAP-210ENST00000498727 PIP4K2BP78356 416 aa29.83■■■□□ 2.37
ILKAP-210ENST00000498727 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
ILKAP-210ENST00000498727 TOM1O60784 492 aa29.81■■■□□ 2.36
ILKAP-210ENST00000498727 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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ILKAP-210ENST00000498727 HSPA1LP34931 641 aa29.77■■■□□ 2.36
ILKAP-210ENST00000498727 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
ILKAP-210ENST00000498727 TNRQ92752 1358 aa29.75■■■□□ 2.35
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